More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3506 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 
361 aa  737    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  58.58 
 
 
370 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  57.3 
 
 
371 aa  421  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  50.52 
 
 
393 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  51.61 
 
 
383 aa  379  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  53.19 
 
 
361 aa  368  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  55.56 
 
 
362 aa  364  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  51.12 
 
 
367 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  51.76 
 
 
376 aa  362  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  50.69 
 
 
364 aa  359  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  48.9 
 
 
362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  46.05 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  48.07 
 
 
362 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  48.91 
 
 
361 aa  354  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  48.9 
 
 
361 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  49.45 
 
 
361 aa  354  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  53.63 
 
 
351 aa  354  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  51.79 
 
 
351 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  48.9 
 
 
361 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  48.9 
 
 
361 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  48.9 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  48.62 
 
 
361 aa  352  7e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  51.1 
 
 
351 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  50.68 
 
 
366 aa  351  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  48.2 
 
 
365 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  49.31 
 
 
357 aa  348  7e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  49.03 
 
 
356 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  49.03 
 
 
356 aa  348  1e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  45.98 
 
 
362 aa  345  7e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  49.04 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  49.59 
 
 
351 aa  335  7e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  49.59 
 
 
352 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  45.73 
 
 
359 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  43.21 
 
 
364 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1199  D-alanyl-alanine synthetase A  50.97 
 
 
349 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  43.82 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  42.66 
 
 
343 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  47.32 
 
 
339 aa  314  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  42.13 
 
 
360 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  44.86 
 
 
389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  42.3 
 
 
360 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  43.36 
 
 
367 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  43.72 
 
 
366 aa  299  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08790  D-alanine--D-alanine ligase  45.75 
 
 
379 aa  298  7e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0347411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  46.41 
 
 
363 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  43.01 
 
 
363 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  43.8 
 
 
366 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  42.15 
 
 
364 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  42.15 
 
 
364 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  43.09 
 
 
366 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1331  D-alanyl-alanine synthetase A  42.66 
 
 
361 aa  294  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  45.94 
 
 
350 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  41.87 
 
 
364 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  41.87 
 
 
364 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  41.87 
 
 
364 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 
364 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  42.54 
 
 
353 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2375  D-alanyl-alanine synthetase A  47.38 
 
 
347 aa  292  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.875604  normal  0.964847 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0872  D-alanyl-alanine synthetase A  44.01 
 
 
348 aa  292  6e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.658926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  44.86 
 
 
377 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  42.78 
 
 
364 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  42.78 
 
 
364 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 
364 aa  292  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 
364 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 
364 aa  292  7e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17261  D-alanyl-alanine synthetase A  43.94 
 
 
348 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.82734  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 
364 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  42.78 
 
 
364 aa  292  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  39.33 
 
 
363 aa  291  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  43.05 
 
 
348 aa  291  2e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  43.97 
 
 
400 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  41.97 
 
 
368 aa  290  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  40.56 
 
 
360 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  43.14 
 
 
358 aa  290  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  45.35 
 
 
350 aa  289  4e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  43.45 
 
 
364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  42.93 
 
 
372 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  45.86 
 
 
363 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  42.58 
 
 
367 aa  287  2e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02772  D-alanyl-alanine synthetase A  44.44 
 
 
369 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  45.8 
 
 
382 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1363  D-alanine--D-alanine ligase  44.32 
 
 
376 aa  285  8e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.905553  normal  0.282026 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  46.15 
 
 
369 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  45.48 
 
 
355 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  44.84 
 
 
382 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  44.2 
 
 
376 aa  281  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  43.55 
 
 
377 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  40.22 
 
 
375 aa  276  5e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  44.69 
 
 
373 aa  275  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1233  D-ala D-ala ligase N-terminal domain protein  41.64 
 
 
380 aa  275  8e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000148623 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  41.9 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  43.21 
 
 
386 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1112  D-alanyl-alanine synthetase A  39.44 
 
 
395 aa  273  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  41.34 
 
 
394 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  43.18 
 
 
348 aa  271  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  45.96 
 
 
353 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  37.05 
 
 
355 aa  269  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  36.49 
 
 
355 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  40.56 
 
 
364 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  40.56 
 
 
364 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>