More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3492 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3492  pseudouridine synthase  100 
 
 		 560 aa  1145    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1462  hypothetical protein  40.51 
 
 		 318 aa  204  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.241812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1777  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  44.93 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00553261  decreased coverage  0.000101871 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0411  tRNA pseudouridine synthase C  43.69 
 
 		 244 aa  150  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03241  tRNA pseudouridine synthase C  39.74 
 
 		 255 aa  148  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002742  tRNA pseudouridine synthase C  40.17 
 
 		 256 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.766432  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  41.81 
 
 		 235 aa  143  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1442  pseudouridylate synthase  40.93 
 
 		 223 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.81175  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0667  hypothetical protein  28.42 
 
 		 390 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3940  pseudouridine synthase  41.01 
 
 		 232 aa  141  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2488  pseudouridylate synthase  40 
 
 		 223 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3171  tRNA pseudouridine synthase C  41.44 
 
 		 260 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1377  pseudouridylate synthase  41.4 
 
 		 223 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1430  pseudouridine synthase  40.47 
 
 		 223 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3366  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3046  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.65 
 
 		 332 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0935  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 266 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0522  pseudouridine synthase, RluA family  39.65 
 
 		 304 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1163  hypothetical protein  28.07 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.809319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0687  hypothetical protein  29.51 
 
 		 384 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.46442  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1141  hypothetical protein  28.07 
 
 		 390 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.432078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2886  pseudouridine synthase  40.47 
 
 		 223 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2987  tRNA pseudouridine synthase C  39.64 
 
 		 261 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0267  tRNA pseudouridine synthase C  41.2 
 
 		 270 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.56 
 
 		 321 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0611  pseudouridine synthase  37.66 
 
 		 241 aa  134  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1435  SAM-dependent methyltransferase-like protein  33.89 
 
 		 401 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.112315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  36.53 
 
 		 302 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3095  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 260 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352774  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1566  pseudouridine synthase  40 
 
 		 223 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.232461  hitchhiker  0.00000912019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1467  pseudouridine synthase  39.91 
 
 		 217 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3171  tRNA pseudouridine synthase C  40.09 
 
 		 260 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.316896  normal  0.156294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3796  tRNA pseudouridine synthase C  37.3 
 
 		 256 aa  134  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461215 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  36.84 
 
 		 323 aa  133  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1630  pseudouridylate synthase  36.36 
 
 		 223 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.427552  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02636  tRNA pseudouridine synthase  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.908245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0897  pseudouridine synthase  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3081  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.495199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4054  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2931  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0921  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02598  hypothetical protein  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.908938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2935  tRNA pseudouridine synthase C  39.19 
 
 		 260 aa  133  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3106  tRNA pseudouridine synthase C  40.09 
 
 		 260 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2844  pseudouridine synthase  43.27 
 
 		 249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.556308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2949  pseudouridine synthase  43.48 
 
 		 239 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.316024  hitchhiker  0.00664146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2791  pseudouridine synthase  40 
 
 		 223 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2811  pseudouridine synthase  40.57 
 
 		 223 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0225697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  36.09 
 
 		 305 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3124  tRNA pseudouridine synthase C  39.64 
 
 		 260 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.756442 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1380  hypothetical protein  29.45 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0930599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0492  pseudouridine synthase, RluA family  42 
 
 		 325 aa  131  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113875 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37 
 
 		 306 aa  131  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3244  tRNA pseudouridine synthase C  38.39 
 
 		 261 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.392486 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2722  pseudouridine synthase  42.51 
 
 		 239 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0650  putative SAM-dependent methyltransferase  32.73 
 
 		 400 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0447  pseudouridylate synthase  37.55 
 
 		 222 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129188  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  38.26 
 
 		 541 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3286  tRNA pseudouridine synthase C  39.64 
 
 		 260 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.923379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0713  tRNA pseudouridine synthase C  37.95 
 
 		 263 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2869  tRNA pseudouridine synthase C  38.16 
 
 		 242 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.97 
 
 		 343 aa  130  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  35.55 
 
 		 578 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3187  tRNA pseudouridine synthase C  39.64 
 
 		 260 aa  130  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.719199 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0912  pseudouridine synthase, RluA family  37.66 
 
 		 558 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00634483 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0259  SAM-dependent methyltransferase  30.43 
 
 		 389 aa  130  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.966549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4665  hypothetical protein  29.21 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  39.56 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1068  SAM-dependent methyltransferases  31.29 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000202436  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1284  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  37.62 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  36.67 
 
 		 343 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  36.11 
 
 		 342 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1096  pseudouridylate synthase  38.71 
 
 		 232 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1658  RluA family pseudouridine synthase  39.81 
 
 		 329 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.615207  normal  0.0770781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  37.39 
 
 		 376 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  36.05 
 
 		 306 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  38.36 
 
 		 330 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1413  pseudouridine synthase, RluA family  34.7 
 
 		 293 aa  128  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0119542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1600  pseudouridine synthase, RluA family  39.35 
 
 		 525 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  37.85 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0655  pseudouridine synthase  38.57 
 
 		 241 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  39.05 
 
 		 229 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1322  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.19 
 
 		 297 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3654  pseudouridine synthase  40.89 
 
 		 225 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4650  hypothetical protein  28.87 
 
 		 399 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1977  hypothetical protein  33.94 
 
 		 297 aa  127  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.257048  hitchhiker  0.000740302 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0375  RluA family pseudouridine synthase  34.53 
 
 		 299 aa  127  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000429003  hitchhiker  0.000000000105454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2911  pseudouridine synthase  39.29 
 
 		 287 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  35.27 
 
 		 324 aa  127  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4435  hypothetical protein  28.52 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  33.19 
 
 		 300 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1442  pseudouridine synthase  39.29 
 
 		 287 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4780  hypothetical protein  28.52 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.25 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4653  hypothetical protein  28.52 
 
 		 399 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.25 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4274  methyltransferase  28.52 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.314948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  34.25 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2390  pseudouridine synthase, RluA family  38.5 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.837448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  36 
 
 		 334 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>