156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3442 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3442  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
342 aa  688    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  35.37 
 
 
365 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  31.61 
 
 
357 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  33.97 
 
 
362 aa  85.9  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  30.32 
 
 
388 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2424  anti-sigma-factor antagonist  28.11 
 
 
317 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  32.8 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 
568 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  28.65 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  36.84 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  31.94 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.61 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  33.54 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  31.79 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  34.19 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 
655 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  24.51 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  36.72 
 
 
511 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  37.39 
 
 
523 aa  76.3  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  32.84 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  33.91 
 
 
559 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  29.78 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  34.76 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  29.23 
 
 
367 aa  75.9  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  34.09 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  32.72 
 
 
549 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  33.06 
 
 
689 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  32.7 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  39.62 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
439 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  32.85 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  39.17 
 
 
506 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  31.39 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  36.79 
 
 
653 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
653 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  35.82 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  34.42 
 
 
492 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  35.57 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 
556 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  31.39 
 
 
424 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  32.96 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  30.91 
 
 
372 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
653 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 
445 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 
366 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  34 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  32.89 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  33.99 
 
 
325 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2986  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 
638 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  30.77 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  26.69 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2503  anti-sigma-factor antagonist  32.81 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.244324 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  31.21 
 
 
549 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  35.45 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  33.58 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 
562 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  35.42 
 
 
492 aa  69.3  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  30.72 
 
 
444 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  31.88 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  31.36 
 
 
538 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  33.12 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  31.71 
 
 
484 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
667 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  34.82 
 
 
294 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  26.71 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  35.25 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  36.56 
 
 
429 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3688  anti-sigma-factor antagonist  23.51 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109455  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  33.93 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  32.67 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  31.65 
 
 
271 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
509 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0413  anti-sigma-factor antagonist  31.07 
 
 
388 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  32.77 
 
 
252 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
271 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  31.9 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  29.53 
 
 
372 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 
510 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3508  anti-sigma-factor antagonist  28.08 
 
 
359 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0621  anti-sigma-factor antagonist  26.25 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0312248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  32.52 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  32.52 
 
 
284 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2689  anti-sigma-factor antagonist  32.56 
 
 
314 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2715  anti-sigma-factor antagonist  32.17 
 
 
341 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  32.5 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>