More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3439 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
445 aa  864    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  48.55 
 
 
412 aa  325  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  39.11 
 
 
385 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 
396 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  36.41 
 
 
387 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  36.41 
 
 
387 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  36.41 
 
 
387 aa  250  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  36 
 
 
387 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  36 
 
 
387 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  36 
 
 
387 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  35.5 
 
 
387 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  36.41 
 
 
387 aa  249  7e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  36.16 
 
 
387 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  37.86 
 
 
375 aa  247  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  39.75 
 
 
400 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  40.72 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  35.25 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  37.14 
 
 
375 aa  244  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  36.55 
 
 
375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  36.81 
 
 
375 aa  241  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  36.81 
 
 
375 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  36.81 
 
 
375 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  36.81 
 
 
375 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  36.81 
 
 
375 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  38.25 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  37.16 
 
 
382 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  36.55 
 
 
375 aa  230  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  36.55 
 
 
375 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  36.55 
 
 
375 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.6 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  38.65 
 
 
399 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  35.83 
 
 
386 aa  203  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 
395 aa  200  5e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  34.69 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  33.65 
 
 
423 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 
392 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  33.16 
 
 
389 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  36.64 
 
 
392 aa  190  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  35.88 
 
 
392 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  39.23 
 
 
413 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  32.02 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  35.23 
 
 
379 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  38.36 
 
 
415 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  38.78 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.08 
 
 
427 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  32.77 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.56 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  28.63 
 
 
479 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  35.32 
 
 
385 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  28.63 
 
 
479 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
424 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  32.27 
 
 
423 aa  163  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  32.02 
 
 
398 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 
750 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  29.68 
 
 
388 aa  158  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  32.54 
 
 
491 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 
388 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0325  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
398 aa  153  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.4 
 
 
352 aa  153  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  30.57 
 
 
388 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  31.2 
 
 
389 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 
388 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  30.24 
 
 
748 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2295  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.784703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  30.39 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  30.82 
 
 
749 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.89 
 
 
414 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 
586 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 
586 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  31.96 
 
 
586 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
390 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
467 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  32.71 
 
 
467 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  31.61 
 
 
585 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  31.7 
 
 
586 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  31.61 
 
 
585 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  28.75 
 
 
414 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  31.19 
 
 
587 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  30.81 
 
 
745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  28.18 
 
 
756 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  29.57 
 
 
474 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.57 
 
 
587 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0547  Kef-type K+ transport systems, membrane component  30.75 
 
 
318 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  30.21 
 
 
402 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  30.43 
 
 
473 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.31 
 
 
587 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  29.28 
 
 
741 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 
482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  30.93 
 
 
453 aa  136  7.000000000000001e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  31.01 
 
 
585 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  31.27 
 
 
585 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  30.37 
 
 
420 aa  136  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  31.27 
 
 
585 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0960  Sodium/hydrogen exchanger  31.76 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.848142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  29.59 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0433  sodium/hydrogen exchanger  28.21 
 
 
387 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.129504  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  28.43 
 
 
764 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.23 
 
 
460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 
448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>