More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3275 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 146 aa  292  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  89.93 
 
 		 151 aa  255  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  85.42 
 
 		 144 aa  246  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  85.42 
 
 		 144 aa  246  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  77.86 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  77.86 
 
 		 144 aa  216  7e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  77.86 
 
 		 144 aa  216  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  77.78 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 		 137 aa  203  6e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 		 137 aa  203  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  72.6 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 140 aa  199  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 137 aa  199  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 137 aa  199  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 140 aa  199  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 135 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  77.04 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 137 aa  197  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 		 137 aa  197  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 135 aa  197  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  76.3 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 123 aa  196  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  75.56 
 
 		 140 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  77.61 
 
 		 137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  74.81 
 
 		 137 aa  195  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 139 aa  193  6e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  192  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 123 aa  192  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  72.59 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2912  ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000187241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 123 aa  191  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2624  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000552514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  69.23 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  72.59 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  71.74 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  72.59 
 
 		 123 aa  188  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 125 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 124 aa  187  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 125 aa  187  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 125 aa  186  7e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  71.64 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  71.64 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  71.85 
 
 		 138 aa  186  9e-47  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 128 aa  186  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 126 aa  186  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  69.85 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  71.33 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0194  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00424917  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  64.67 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  68.89 
 
 		 202 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  71.11 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  68.89 
 
 		 124 aa  184  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000216882  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  68.89 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  67.14 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  68.89 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  0.0000000329491 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  68.15 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0143  30S ribosomal protein S12  68.89 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000877595  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  68.38 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  67.14 
 
 		 128 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1674  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  hitchhiker  0.0029615 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 135 aa  184  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 122 aa  184  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  69.63 
 
 		 123 aa  183  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  68.89 
 
 		 124 aa  183  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  183  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>