205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3266 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  100 
 
 
281 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  65.47 
 
 
286 aa  350  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  65.57 
 
 
286 aa  346  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  57.51 
 
 
273 aa  323  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  50.71 
 
 
279 aa  271  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  44.91 
 
 
275 aa  226  5.0000000000000005e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  44.52 
 
 
275 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  42.7 
 
 
290 aa  214  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  25.75 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 
267 aa  69.7  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2878  ABC-2 type transporter  25.67 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.7 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.51 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.11 
 
 
249 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 
247 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  29.56 
 
 
249 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.87 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  27.46 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  28.66 
 
 
281 aa  60.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 
248 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 
371 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.33 
 
 
264 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.37 
 
 
280 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.9 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.26 
 
 
369 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  26.54 
 
 
270 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  24.34 
 
 
360 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 
241 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  28.68 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.19 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 
254 aa  53.5  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 
267 aa  53.5  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  25.65 
 
 
370 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
336 aa  52.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 
360 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.62 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2134  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.92699  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  24.11 
 
 
339 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
290 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 
271 aa  52.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.62 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  34.52 
 
 
268 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  47.92 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0291  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  23.2 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  23.2 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 
390 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.73 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.1 
 
 
375 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
370 aa  50.4  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  38.2 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.58 
 
 
365 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.95 
 
 
253 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 
251 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
363 aa  49.7  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  22.7 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  39.29 
 
 
276 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  27.87 
 
 
260 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 
270 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  28.87 
 
 
370 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  24.48 
 
 
245 aa  48.9  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
268 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 
372 aa  48.9  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 
269 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1518  ABC-2 type transporter  21.6 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 
356 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  27.81 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1137  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.18489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  27.61 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1478  ABC-2 type transporter  21.6 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  25 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 
370 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.62 
 
 
250 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  25.15 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  28.87 
 
 
371 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.67 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
280 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>