136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3241 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  100 
 
 
789 aa  1586    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  69.44 
 
 
842 aa  285  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  65.96 
 
 
787 aa  282  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  71.86 
 
 
600 aa  276  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  36.97 
 
 
487 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  40.24 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  35.05 
 
 
421 aa  117  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  36.02 
 
 
381 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  31.34 
 
 
507 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  30.19 
 
 
501 aa  114  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  30.19 
 
 
498 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  32.32 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  30.19 
 
 
498 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  30.19 
 
 
498 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  33.14 
 
 
508 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  35.4 
 
 
564 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  35.19 
 
 
483 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  35.4 
 
 
477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  35.19 
 
 
483 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  34.78 
 
 
440 aa  111  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  33.14 
 
 
496 aa  111  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  34.81 
 
 
480 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  34.18 
 
 
478 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  35.4 
 
 
308 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  31.17 
 
 
260 aa  109  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  36.75 
 
 
412 aa  107  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  33.74 
 
 
275 aa  100  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  32.62 
 
 
249 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  33.87 
 
 
253 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  33.7 
 
 
253 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0052  protein of unknown function DUF88  37.35 
 
 
470 aa  92  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  30.43 
 
 
264 aa  88.6  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1042  protein of unknown function DUF88  35.8 
 
 
378 aa  86.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.18689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4443  hypothetical protein  25.91 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1542  hypothetical protein  26.26 
 
 
272 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2090  hypothetical protein  27.43 
 
 
268 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0898  hypothetical protein  24.86 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0915  hypothetical protein  24.86 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281794  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0904  hypothetical protein  24.86 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.070358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1014  hypothetical protein  24.32 
 
 
299 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.206165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18070  Protein of unknown function DUF88  25.13 
 
 
335 aa  70.5  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.304133  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1934  protein of unknown function DUF88  25.57 
 
 
552 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000288494  normal  0.0274849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15160  conserved hypothetical protein TIGR00288  28.3 
 
 
371 aa  62  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3691  hypothetical protein  28.92 
 
 
272 aa  62  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3232  hypothetical protein  26.63 
 
 
419 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0597283  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  25.29 
 
 
282 aa  61.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  27.04 
 
 
432 aa  60.8  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1404  protein of unknown function DUF88  29.01 
 
 
296 aa  60.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.516072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0207  hypothetical protein  24.52 
 
 
194 aa  58.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00903203  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0118  hypothetical protein  28.74 
 
 
286 aa  58.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0707  protein of unknown function DUF88  30.27 
 
 
258 aa  57.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000235983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3395  hypothetical protein  29.93 
 
 
432 aa  57.4  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1878  protein of unknown function DUF88  24.18 
 
 
320 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.176137  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  26.88 
 
 
195 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0855  hypothetical protein  23.33 
 
 
183 aa  56.6  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000154365  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0670  protein of unknown function DUF88  32.19 
 
 
234 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135963  normal  0.923562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0650  protein of unknown function DUF88  32.19 
 
 
234 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3535  hypothetical protein  27.71 
 
 
264 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.098439  normal  0.0144387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0671  hypothetical protein  26.16 
 
 
192 aa  55.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.420654  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0373  hypothetical protein  21.81 
 
 
215 aa  55.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0316  hypothetical protein  27.5 
 
 
264 aa  54.7  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0532  protein of unknown function DUF88  28 
 
 
321 aa  54.7  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5405  protein of unknown function DUF88  28.5 
 
 
450 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.964746  normal  0.435049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0806  protein of unknown function DUF88  31.68 
 
 
246 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806829  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1924  protein of unknown function DUF88  27.21 
 
 
334 aa  54.3  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  unclonable  0.0000000129019 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1873  hypothetical protein  27.78 
 
 
252 aa  53.9  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  25.15 
 
 
319 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0520  hypothetical protein  25.3 
 
 
262 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2410  hypothetical protein  28.31 
 
 
259 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.727494  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0304  hypothetical protein  22.5 
 
 
215 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0105  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  53.5  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1822  hypothetical protein  28.21 
 
 
275 aa  52.8  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.81231  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1608  hypothetical protein  22.5 
 
 
215 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2071  hypothetical protein  25.79 
 
 
247 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000154426  normal  0.408823 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1475  hypothetical protein  25.79 
 
 
229 aa  52  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3603  protein of unknown function DUF88  32.19 
 
 
259 aa  51.6  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162611  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2419  hypothetical protein  26.06 
 
 
247 aa  51.6  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2484  hypothetical protein  24.05 
 
 
439 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00113577  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0543  hypothetical protein  22.58 
 
 
193 aa  51.2  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3082  hypothetical protein  35.06 
 
 
261 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407546  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  47.62 
 
 
709 aa  49.7  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3403  pseudouridine synthase RluD  38.18 
 
 
501 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0666836  normal  0.0916306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0944  hypothetical protein  26.14 
 
 
194 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0294476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1453  hypothetical protein  28.48 
 
 
258 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.55452  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  43.21 
 
 
674 aa  50.1  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1386  hypothetical protein  24.18 
 
 
303 aa  50.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351938  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  42.47 
 
 
347 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0741  protein of unknown function DUF88  25.49 
 
 
251 aa  49.7  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.614685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0704  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0221  hypothetical protein  24.52 
 
 
193 aa  49.3  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6293  protein of unknown function DUF88  25.6 
 
 
262 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2768  hypothetical protein  25.44 
 
 
272 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2044  hypothetical protein  27.5 
 
 
249 aa  48.5  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0376115  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00290  hypothetical protein  26.58 
 
 
249 aa  48.9  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0095  hypothetical protein  26.13 
 
 
273 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0117028  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0675  hypothetical protein  23.67 
 
 
193 aa  48.1  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179061  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  23.42 
 
 
629 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0476  hypothetical protein  28.66 
 
 
265 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05689  hypothetical protein  26.09 
 
 
162 aa  47.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>