More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3224 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.53 
 
 		 944 aa  924    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.65 
 
 		 934 aa  932    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.24 
 
 		 960 aa  716    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.54 
 
 		 956 aa  942    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 927 aa  1911    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.22 
 
 		 930 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.7 
 
 		 921 aa  527  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.85 
 
 		 921 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  32.59 
 
 		 929 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.44 
 
 		 957 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.57 
 
 		 952 aa  458  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.26 
 
 		 929 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.05 
 
 		 934 aa  439  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.4 
 
 		 934 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.59 
 
 		 934 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.4 
 
 		 934 aa  438  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.77 
 
 		 934 aa  439  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.67 
 
 		 934 aa  438  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.84 
 
 		 934 aa  435  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 		 934 aa  436  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 		 934 aa  435  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  30.19 
 
 		 934 aa  436  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  37.16 
 
 		 838 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.34 
 
 		 921 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  35.97 
 
 		 851 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  36.75 
 
 		 876 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  35.79 
 
 		 840 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  33.15 
 
 		 822 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  35.06 
 
 		 843 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  35.43 
 
 		 843 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  33.38 
 
 		 846 aa  392  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  35.52 
 
 		 830 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  35.93 
 
 		 830 aa  386  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  32.96 
 
 		 832 aa  382  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  34.13 
 
 		 709 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  35.43 
 
 		 659 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  34.3 
 
 		 646 aa  364  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.65 
 
 		 966 aa  362  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  34.05 
 
 		 674 aa  361  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  34.2 
 
 		 729 aa  360  7e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  35.15 
 
 		 647 aa  350  8e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  28.46 
 
 		 986 aa  347  7e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  35.18 
 
 		 651 aa  342  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  33.66 
 
 		 754 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.25 
 
 		 978 aa  340  8e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14100  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  26.29 
 
 		 1043 aa  339  1.9999999999999998e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  32.94 
 
 		 640 aa  337  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  33.33 
 
 		 633 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  33.77 
 
 		 650 aa  333  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  30.39 
 
 		 667 aa  332  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.77 
 
 		 650 aa  332  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  32.51 
 
 		 631 aa  330  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  32.65 
 
 		 633 aa  330  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  33 
 
 		 707 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  31.95 
 
 		 647 aa  326  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  32.52 
 
 		 681 aa  326  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  34.85 
 
 		 675 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  31.1 
 
 		 639 aa  322  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  32.71 
 
 		 643 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  32.46 
 
 		 636 aa  321  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  32.42 
 
 		 646 aa  319  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  33.08 
 
 		 635 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  32.41 
 
 		 652 aa  312  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  32.27 
 
 		 652 aa  310  8e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.49 
 
 		 646 aa  308  5.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  31.73 
 
 		 646 aa  304  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.35 
 
 		 644 aa  303  8.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  32.14 
 
 		 664 aa  302  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  26.55 
 
 		 902 aa  300  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  33.24 
 
 		 681 aa  300  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.06 
 
 		 897 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.06 
 
 		 897 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.99 
 
 		 674 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  31.86 
 
 		 640 aa  296  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  32.13 
 
 		 653 aa  296  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  30.61 
 
 		 645 aa  292  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  31.02 
 
 		 659 aa  291  4e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  30.88 
 
 		 659 aa  290  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  31.55 
 
 		 698 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  31.01 
 
 		 641 aa  289  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  29.91 
 
 		 640 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  30.32 
 
 		 664 aa  282  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  30.07 
 
 		 669 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  29.18 
 
 		 640 aa  280  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  31.35 
 
 		 641 aa  280  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  29.33 
 
 		 669 aa  278  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  29.2 
 
 		 651 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  30.23 
 
 		 641 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  31.21 
 
 		 668 aa  276  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  31.43 
 
 		 644 aa  274  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  31.56 
 
 		 649 aa  270  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  32.08 
 
 		 665 aa  267  7e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.41 
 
 		 662 aa  267  8e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1030  Rad3-related DNA helicase  27.07 
 
 		 937 aa  266  1e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0174435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  30.96 
 
 		 674 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  30.91 
 
 		 673 aa  265  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  31.04 
 
 		 664 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  30.34 
 
 		 692 aa  250  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  29.4 
 
 		 673 aa  249  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  32.26 
 
 		 728 aa  247  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>