More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3210 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
137 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  37.4 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1218  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.9 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2981  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4360  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4384  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  34.35 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  33.85 
 
 
132 aa  84  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
130 aa  83.6  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.92 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
134 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  33.59 
 
 
133 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 
133 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  33.87 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  34.96 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0385  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.03 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000075209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  32.31 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0407  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.03 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000267625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0388  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.03 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0448  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.03 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17179e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0393  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.03 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.493726  hitchhiker  2.73635e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4091  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  28.78 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
130 aa  77  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.07 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.3 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2144  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000183728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  32.28 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  32.81 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  32.28 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  32.03 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.86 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  32.48 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  31.97 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.01 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  32.03 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.53 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3397  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  29.77 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
149 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4950  regulatory protein, MerR  36.07 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0034872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.65 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  31.25 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  31.25 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  28.12 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3375  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  32.41 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  27.34 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.25 
 
 
135 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.13 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0171  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.13 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.13 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.13 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.13 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal 
 
 
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NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  29.92 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal 
 
 
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NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.63 
 
 
116 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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