More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3180 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 646 aa  1315    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  29.48 
 
 		 590 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  28.88 
 
 		 590 aa  160  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  29.09 
 
 		 583 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 557 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 557 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  29.06 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 575 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 562 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 622 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  27.91 
 
 		 569 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  29.57 
 
 		 609 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 		 623 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  28.97 
 
 		 656 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  29.88 
 
 		 625 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 616 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  28.43 
 
 		 624 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 559 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 535 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 505 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  24.55 
 
 		 502 aa  114  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  26.37 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25.45 
 
 		 583 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 		 518 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 589 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0866  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein, putative  27.2 
 
 		 504 aa  104  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.94 
 
 		 533 aa  100  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0387  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 552 aa  97.8  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  0.247194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  26.34 
 
 		 524 aa  97.4  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3713  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 669 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  25.24 
 
 		 536 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.69 
 
 		 554 aa  94  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  26.55 
 
 		 530 aa  90.9  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  26.27 
 
 		 530 aa  90.5  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2412  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 459 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 484 aa  89.4  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 468 aa  88.2  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.07 
 
 		 472 aa  87.8  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 472 aa  87.8  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.1 
 
 		 551 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 472 aa  87  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.33 
 
 		 426 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.32 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 556 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.94 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2166  radical SAM family Fe-S protein  25.57 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  22.41 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 564 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.86 
 
 		 609 aa  77  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  28.61 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  25.97 
 
 		 656 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  24.49 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0261  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.74 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 468 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  21.21 
 
 		 494 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  21.21 
 
 		 494 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.1 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  22.5 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  25.21 
 
 		 715 aa  72.4  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 498 aa  72  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  23.44 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 564 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4173  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  21.58 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  21.58 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  23.5 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0780  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  22.71 
 
 		 864 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  22.63 
 
 		 484 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  21.9 
 
 		 545 aa  67  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 486 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.43 
 
 		 479 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>