More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3175 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  100 
 
 
492 aa  1029    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  56.29 
 
 
495 aa  612  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  56.9 
 
 
499 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  57.11 
 
 
499 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  52.88 
 
 
494 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  52.67 
 
 
502 aa  539  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  43.01 
 
 
570 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  42.83 
 
 
570 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  40.94 
 
 
568 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  40.94 
 
 
573 aa  349  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  40.81 
 
 
570 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  41.53 
 
 
551 aa  343  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  38.92 
 
 
571 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  40.51 
 
 
557 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  38.84 
 
 
474 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  36.58 
 
 
421 aa  282  8.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  34.45 
 
 
491 aa  262  8.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  37.6 
 
 
495 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  33.86 
 
 
442 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  33.73 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  33.11 
 
 
473 aa  233  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  33.33 
 
 
441 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  32.55 
 
 
426 aa  230  5e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  31.37 
 
 
421 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  32.13 
 
 
422 aa  226  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  31.9 
 
 
422 aa  224  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  31.67 
 
 
422 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  29.63 
 
 
501 aa  203  7e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  30.29 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  28.34 
 
 
452 aa  162  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  26.37 
 
 
442 aa  136  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.99 
 
 
406 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  26.1 
 
 
485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  26.11 
 
 
470 aa  124  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.9 
 
 
406 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  26.42 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.11 
 
 
414 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.76 
 
 
413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  23.21 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.84 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.61 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.61 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  27.39 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.3 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.3 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  23.44 
 
 
428 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.61 
 
 
419 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  25.71 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  24.69 
 
 
406 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.35 
 
 
406 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  24.69 
 
 
406 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  24.69 
 
 
406 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  25.31 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  25.31 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  25.31 
 
 
406 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  24.69 
 
 
406 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  28.15 
 
 
421 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  25.31 
 
 
406 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  24.69 
 
 
406 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.43 
 
 
406 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.79 
 
 
413 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  30.97 
 
 
393 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.18 
 
 
412 aa  108  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.45 
 
 
416 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.06 
 
 
406 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.89 
 
 
412 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.88 
 
 
413 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.79 
 
 
415 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  28.57 
 
 
417 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2340  aminotransferase class V  27.37 
 
 
421 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0193219  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  24.24 
 
 
394 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4340  aminotransferase class V  24.77 
 
 
403 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.485462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.41 
 
 
896 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2851  aminotransferase, class V  27.37 
 
 
421 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00811  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.14 
 
 
417 aa  103  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.368532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.91 
 
 
415 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.45 
 
 
414 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.73 
 
 
408 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  29.97 
 
 
878 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.54 
 
 
444 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  27.7 
 
 
420 aa  100  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.21 
 
 
414 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.25 
 
 
428 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.14 
 
 
417 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  30.09 
 
 
885 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.01 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  28.4 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.01 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00821  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  24.87 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0072  SufS subfamily cysteine desulfurase  23.68 
 
 
417 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.52 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2386  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.63 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2389  Cysteine desulfurase  25.48 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000376862 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  28.11 
 
 
626 aa  98.2  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.69 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.24 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.83 
 
 
418 aa  97.8  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.54 
 
 
404 aa  97.4  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  22.82 
 
 
394 aa  97.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.3 
 
 
408 aa  97.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>