250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3168 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  694    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  47.32 
 
 
336 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  45.14 
 
 
336 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  29.39 
 
 
324 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 
332 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.44 
 
 
334 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  28.57 
 
 
348 aa  99.8  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 
331 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.13 
 
 
324 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
334 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.19 
 
 
334 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 
339 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  27.8 
 
 
355 aa  90.9  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  26.32 
 
 
363 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  26.61 
 
 
334 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 
324 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  26.45 
 
 
327 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  23.77 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  26.3 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  25.41 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  27.36 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  24.91 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  25.17 
 
 
330 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  25.56 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  26.46 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  27.5 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  24.28 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  23.86 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  26.07 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  24.04 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  25.82 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  25.15 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  22.7 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  27.03 
 
 
346 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  24.01 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  23.88 
 
 
343 aa  69.3  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  24 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1469  beta-lactamase domain-containing protein  26.28 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 
862 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  21.14 
 
 
320 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  22.76 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  23.29 
 
 
323 aa  65.9  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  22.97 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.69 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
240 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  22.91 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  23.86 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  22.76 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  23.59 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  30.29 
 
 
231 aa  63.5  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  25.86 
 
 
352 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
345 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4932  beta-lactamase domain-containing protein  24.43 
 
 
335 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0352  beta-lactamase domain protein  22.36 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  29.14 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1661  beta-lactamase domain protein  27.83 
 
 
241 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 
365 aa  60.5  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  24.1 
 
 
346 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  24.02 
 
 
208 aa  59.7  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 
365 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.54 
 
 
205 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 
205 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1441  beta-lactamase domain-containing protein  25.09 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.610229  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  27.2 
 
 
211 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1889  beta-lactamase domain protein  24.2 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  24.05 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  23.92 
 
 
369 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  28.16 
 
 
213 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 
206 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 
317 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1480  beta-lactamase-like  26.72 
 
 
307 aa  56.2  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.245912  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  24.05 
 
 
317 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  22.61 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3547  hypothetical protein  25 
 
 
255 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152924  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  26.36 
 
 
206 aa  56.2  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0433  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 
340 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151814  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  26.19 
 
 
208 aa  56.2  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 
400 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  23.13 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0204  metallo-beta-lactamase family protein  25.94 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 
210 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  23.53 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2832  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.422682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  23.81 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  24.15 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  24.77 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1374  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 
192 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.09884  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1928  beta-lactamase domain protein  21.99 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  24.15 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  29.6 
 
 
211 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  24.83 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  27.16 
 
 
316 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  28.24 
 
 
198 aa  53.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>