275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3167 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3167  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
306 aa  598  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00198959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0434  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  50.55 
 
 
305 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.837995  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2163  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.39 
 
 
306 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0104507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4203  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  50.92 
 
 
305 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.233468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  37.96 
 
 
248 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.96 
 
 
248 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.02 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0718  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.14 
 
 
248 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.761228  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24340  cytochrome c biogenesis protein  33.77 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2162  cytochrome c-type biogenesis protein  40.32 
 
 
248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20604  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.17 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  35.8 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3090  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.46 
 
 
251 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1322  cytochrome c biogenesis protein CcdA  31.06 
 
 
242 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2966  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.32 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017508  normal  0.369863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5557  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.45 
 
 
286 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354841  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1840  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.71 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1643  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.11 
 
 
249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649003  normal  0.267262 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  31.45 
 
 
403 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2616  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.24 
 
 
244 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  31.45 
 
 
403 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2275  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.99 
 
 
242 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.48 
 
 
218 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.422779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3411  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.97 
 
 
238 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2214  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.62 
 
 
244 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1821  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.22 
 
 
303 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3785  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.16 
 
 
243 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3473  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.5 
 
 
238 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.320099 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4103  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.03 
 
 
242 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3291  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.56 
 
 
251 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.402635  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1830  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.64 
 
 
227 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101258  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0455  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.54 
 
 
259 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1347  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.03 
 
 
301 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.742277  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3738  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.52 
 
 
246 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3606  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.88 
 
 
240 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507935  normal  0.590973 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3944  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.88 
 
 
240 aa  102  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.53 
 
 
253 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1774  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.48 
 
 
244 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  0.604488 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.53 
 
 
248 aa  101  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0690  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.83 
 
 
261 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  33 
 
 
244 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3686  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.51 
 
 
244 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4337  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.51 
 
 
244 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0744461  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0245  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.13 
 
 
246 aa  99.4  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00020253  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4965  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.23 
 
 
247 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4125  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.64 
 
 
399 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0162627 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3645  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4478  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.04 
 
 
249 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4309  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.04 
 
 
249 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117194  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4209  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.04 
 
 
249 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1647  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.35 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000260345  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1626  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.35 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000154632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1596  cytochrome c-type biogenesis protein  32.35 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000857719  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1778  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.35 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1828  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.35 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3552  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.35 
 
 
237 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.730685  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1792  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  32.35 
 
 
237 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  36.87 
 
 
396 aa  95.9  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1951  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.79 
 
 
237 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1660  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.39 
 
 
237 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.36 
 
 
229 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2451  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.5 
 
 
242 aa  95.5  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0258924  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0818  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.91 
 
 
244 aa  95.5  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.20883 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10538  cytochrome C-type biogenesis protein ccdA  33.33 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000404989  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  32.79 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0681  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.65 
 
 
229 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4432  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.76 
 
 
266 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.229211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18190  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33 
 
 
225 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000578008  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.26 
 
 
245 aa  94  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.19 
 
 
264 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24700  cytochrome c biogenesis protein  31.13 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0270  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.27 
 
 
243 aa  92.8  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.584901  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6714  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.95 
 
 
266 aa  93.2  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1522  cytochrome c biogenesis protein  32.54 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00325926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.51 
 
 
237 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0184  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.92 
 
 
281 aa  92.8  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.19 
 
 
253 aa  92.8  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1771  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.95 
 
 
245 aa  92.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3695  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3455  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3417  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.297726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3367  cytochrome c-type biogenesis protein (holocytochrome-c synthase)  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.260903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2813  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein  32.42 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3727  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.36 
 
 
250 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3348  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000571426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0933  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.14 
 
 
228 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.836519  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3703  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3679  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.98 
 
 
235 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.91 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0180  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane  33.33 
 
 
240 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00413997  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  31.91 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3768  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.45 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2146  cytochrome c biogenesis protein  30.08 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0617125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.2 
 
 
241 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2596  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.54 
 
 
236 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.74 
 
 
240 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.74 
 
 
240 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1548  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  35.45 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00245036  hitchhiker  0.0095954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.68 
 
 
222 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>