More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3151 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3151  thioredoxin  100 
 
 
113 aa  232  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3466  thioredoxin  56.19 
 
 
110 aa  140  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.086218  normal  0.618776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4407  thioredoxin  53.33 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4105  thioredoxin  52.34 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031473  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  49.02 
 
 
107 aa  122  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3294  thioredoxin  52.38 
 
 
109 aa  122  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00620964  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  51.49 
 
 
124 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  51.49 
 
 
107 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  47.06 
 
 
107 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  47.06 
 
 
107 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  48.51 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09121  thioredoxin  50.5 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.48 
 
 
148 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  47.52 
 
 
123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  45 
 
 
106 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  43.27 
 
 
125 aa  116  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  46.53 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0338  thioredoxin  44.66 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1199  thioredoxin  47.37 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000534537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  42.72 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  45.54 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  44.76 
 
 
107 aa  114  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  44.76 
 
 
107 aa  114  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0984  thioredoxin  42.86 
 
 
110 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1138  thioredoxin  46.88 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.898127  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0630  thioredoxin  44.76 
 
 
107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000762931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  42.57 
 
 
107 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  41.75 
 
 
109 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  46.6 
 
 
108 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  44.12 
 
 
107 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_599  thioredoxin  43.81 
 
 
107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000130429  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  51.04 
 
 
108 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  44.55 
 
 
107 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  43.69 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  43.14 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  50.55 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0646  thioredoxin  45.63 
 
 
111 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  42.16 
 
 
109 aa  112  3e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2211  thioredoxin  43.4 
 
 
108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2211  thioredoxin  47.78 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000765425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  43.93 
 
 
259 aa  111  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  47.78 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  48 
 
 
108 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1501  thioredoxin  45.1 
 
 
110 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  44.9 
 
 
109 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2357  thioredoxin  45.1 
 
 
110 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.565357  normal  0.741235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4110  thioredoxin  43.4 
 
 
108 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.465308  hitchhiker  0.0000724164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  44.34 
 
 
109 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  42.72 
 
 
105 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  49.45 
 
 
108 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  46.6 
 
 
133 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  42.72 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23390  thioredoxin  46.15 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  45.71 
 
 
259 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  42.72 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  42.86 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  40 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2639  thioredoxin  47.06 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0886828  hitchhiker  0.00590655 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  44.34 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  45.63 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2067  thioredoxin  39.6 
 
 
107 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  45.28 
 
 
120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  45.63 
 
 
106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1667  thioredoxin  42.31 
 
 
110 aa  108  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000000131883  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  46.88 
 
 
105 aa  108  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  51.52 
 
 
104 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  41.51 
 
 
108 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  44.66 
 
 
110 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  47.83 
 
 
109 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  39.62 
 
 
108 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  44.34 
 
 
108 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  47.25 
 
 
108 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  43.69 
 
 
108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0530  thioredoxin  44 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303131  normal  0.878071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  41.75 
 
 
105 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  45.63 
 
 
106 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0813  thioredoxin  41.58 
 
 
109 aa  107  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  48.35 
 
 
108 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  43.4 
 
 
108 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  45.83 
 
 
108 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  41.35 
 
 
110 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  48.35 
 
 
108 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0867  thioredoxin  37.86 
 
 
105 aa  107  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.800963  hitchhiker  0.0030343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2323  thioredoxin  43.69 
 
 
110 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1673  thioredoxin  43.69 
 
 
109 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.172284  hitchhiker  0.000827642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  43.27 
 
 
110 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1513  thioredoxin  39.62 
 
 
109 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000429326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  43.56 
 
 
106 aa  106  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  45.83 
 
 
108 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>