42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3112 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3112  tyramine oxidase  100 
 
 
392 aa  823    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00819948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8167  Cu2+-containing amine oxidase-like protein  38.48 
 
 
431 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0769663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3876  Primary-amine oxidase  24.62 
 
 
643 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2269  tyramine oxidase  24.46 
 
 
757 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1473  tyramine oxidase  24.46 
 
 
757 aa  92  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01371  hypothetical protein  24.46 
 
 
650 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2259  Amine oxidase (copper-containing)  24.46 
 
 
757 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01358  tyramine oxidase, copper-requiring  24.46 
 
 
572 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1571  tyramine oxidase  24.46 
 
 
757 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1133  tyramine oxidase  24.74 
 
 
652 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.572136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4125  tyramine oxidase  23.62 
 
 
673 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.918709  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2000  tyramine oxidase  24.38 
 
 
671 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1871  tyramine oxidase  23.68 
 
 
641 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160307  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2046  tyramine oxidase  24.38 
 
 
671 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1981  tyramine oxidase  24.38 
 
 
671 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1115  tyramine oxidase  24.45 
 
 
670 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.458692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2979  tyramine oxidase  23.74 
 
 
644 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1997  tyramine oxidase  23.5 
 
 
661 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.809964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3407  tyramine oxidase  24.23 
 
 
670 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.417873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4963  tyramine oxidase  23.27 
 
 
643 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7247  tyramine oxidase  23.35 
 
 
675 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0305424 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12808  predicted protein  23.21 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1923  Primary-amine oxidase  23.29 
 
 
656 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265873  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2218  tyramine oxidase  22.9 
 
 
659 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523259  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1742  Primary-amine oxidase  24.55 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197587  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83878  copper-containing amine oxidase  26.87 
 
 
663 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08454  copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_3G00680)  23.81 
 
 
666 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.601756  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3126  tyramine oxidase  24.69 
 
 
670 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112129  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3451  tyramine oxidase  23.33 
 
 
660 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07641  peroxisomal copper amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G07360)  23.17 
 
 
683 aa  73.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.619902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2477  Primary-amine oxidase  21.61 
 
 
660 aa  73.2  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2627  tyramine oxidase  21.89 
 
 
644 aa  70.1  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.818449  normal  0.540036 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3502  tyramine oxidase  24.33 
 
 
641 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1383  tyramine oxidase  21.48 
 
 
664 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3572  tyramine oxidase  23.91 
 
 
669 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05690  conserved hypothetical protein  22.31 
 
 
668 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06092  conserved hypothetical protein  25.88 
 
 
817 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0222386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4489  hypothetical protein  27.94 
 
 
516 aa  59.7  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.028276  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3066  Amine oxidase (copper-containing)  21.94 
 
 
674 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0325099  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01110  copper amine oxidase, putative  24.07 
 
 
801 aa  56.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55523  peroxisomal copper amine oxidase  23.45 
 
 
714 aa  50.8  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01586  amine oxidase (AFU_orthologue; AFUA_1G13440)  25.64 
 
 
682 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>