155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3106 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  100 
 
 		 108 aa  217  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3034  FmdB family regulatory protein  69.57 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2140  FmdB family regulatory protein  75 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.0886847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1727  regulatory protein, FmdB family  59.04 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0359754  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3272  regulatory protein, FmdB family  47.73 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.248123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  61.02 
 
 		 132 aa  90.5  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0161  FmdB family regulatory protein  57.58 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.740481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4089  regulatory protein, FmdB family  55.38 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  63.93 
 
 		 93 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6324  regulatory protein, FmdB family  45.87 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  51.28 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0488  regulatory protein, FmdB family  53.85 
 
 		 107 aa  84.7  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.813132  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  60.71 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000506128  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  47.06 
 
 		 71 aa  83.6  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4042  hypothetical protein  48.86 
 
 		 125 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2573  regulatory protein, FmdB family  54.55 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135331 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  55.38 
 
 		 119 aa  83.6  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0371  hypothetical protein  59.65 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  57.14 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2866  FmdB family regulatory protein  54.55 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30590  putative regulatory protein, FmdB family  56.14 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0140948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  58.62 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8652  putative regulatory protein, FmdB family  58.93 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2815  regulatory protein, FmdB family  56.9 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.640652  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  51.52 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  51.52 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0108  regulatory protein, FmdB family  55.36 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0629373  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4835  FmdB family regulatory protein  53.12 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  56.9 
 
 		 113 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  45.56 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2661  hypothetical protein  53.33 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  53.33 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  58.93 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1895  FmdB family regulatory protein  55.17 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.448819  normal  0.145207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11009  serine rich protein  48.48 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.667745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3191  FmdB family regulatory protein  56.6 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  56.9 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  48.21 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23900  putative regulatory protein, FmdB family  51.72 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32690  putative regulatory protein, FmdB family  58.49 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.914233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  37.37 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0908  regulatory protein, FmdB family  52.83 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  42.86 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  39.08 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16440  putative regulatory protein, FmdB family  51.72 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.324116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  39.36 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  34.09 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  34.09 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1970  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  39.76 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000232466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  43.06 
 
 		 109 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  36.67 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000617496  unclonable  0.00000827491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  41.27 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  46.03 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  41.27 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  44.59 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  39.44 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  39.36 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  42.47 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2468  hypothetical protein  45.59 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0737911 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1830  regulatory protein, FmdB family  41.79 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  39.53 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  40.24 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  40.24 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  38.64 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  42.42 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  37.21 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0781  FmdB family regulatory protein  36.62 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000492398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2497  FmdB family regulatory protein  43.37 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0804  FmdB family regulatory protein  36.62 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000263979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  36.67 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1673  hypothetical protein  45.61 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  40.51 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  42.62 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  0.0000000881745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  36.26 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  37.93 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2115  FmdB transcriptional regulator  40.3 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  41.79 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2727  FmdB family regulatory protein  40.3 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  36.17 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2754  FmdB family regulatory protein  40.3 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0326543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  37.35 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1094  FmdB transcriptional regulator  37.63 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176161  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2117  hypothetical protein  40.91 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.145688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  41.79 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  32.58 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145953  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  48.33 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2778  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0875  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2645  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.596631  normal  0.169906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  43.48 
 
 		 108 aa  60.8  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  42.62 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.36361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>