More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3102 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1211 aa  2462  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
1174 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 
1014 aa  345  4e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
1017 aa  332  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
719 aa  274  9e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
711 aa  263  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
726 aa  222  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
677 aa  221  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4216  diguanylate cyclase  29.51 
 
 
717 aa  198  5e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 
2153 aa  170  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5362  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
643 aa  169  3e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
3470 aa  164  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.75 
 
 
944 aa  162  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3340  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
557 aa  162  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.56 
 
 
884 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
933 aa  159  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  28.98 
 
 
1629 aa  151  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
911 aa  151  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.88 
 
 
905 aa  150  1e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
508 aa  147  8e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
634 aa  147  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
509 aa  147  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
511 aa  147  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
725 aa  145  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
893 aa  144  1e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.74 
 
 
1207 aa  143  2e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
726 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.62189  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  35.04 
 
 
1111 aa  142  5e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  29.83 
 
 
617 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.17 
 
 
762 aa  139  3e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 
556 aa  139  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 
1291 aa  138  7e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
758 aa  137  1e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 
1043 aa  137  1e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
612 aa  137  1e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
827 aa  136  2e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
829 aa  136  2e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 
880 aa  136  2e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  28.8 
 
 
565 aa  136  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 
1021 aa  135  4e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  25.26 
 
 
595 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
399 aa  135  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1064 aa  135  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
396 aa  134  8e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  33.33 
 
 
906 aa  134  1e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
639 aa  134  1e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
556 aa  134  1e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6283  alginate biosynthesis sensor protein KinB  25.99 
 
 
595 aa  134  1e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 
508 aa  133  2e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
1026 aa  132  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
638 aa  132  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.230801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3109  sensor protein  32.77 
 
 
485 aa  132  4e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
392 aa  132  4e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
606 aa  131  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
639 aa  131  7e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.73 
 
 
1131 aa  131  8e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 
546 aa  131  9e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 
639 aa  131  1e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
906 aa  130  1e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
641 aa  130  1e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1099  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
430 aa  130  2e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  2.4984e-08 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
958 aa  130  2e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
953 aa  129  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
359 aa  129  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
2161 aa  129  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
604 aa  129  4e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.97924e-10  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
392 aa  129  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
754 aa  128  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
592 aa  128  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.5 
 
 
885 aa  128  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
582 aa  128  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
1060 aa  128  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
557 aa  128  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
883 aa  128  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
1158 aa  128  8e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
755 aa  127  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
378 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
612 aa  127  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
640 aa  127  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.3 
 
 
1274 aa  127  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 
533 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
718 aa  126  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
1039 aa  126  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.91257e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
581 aa  126  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
579 aa  126  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
902 aa  125  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
698 aa  125  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
640 aa  125  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
838 aa  125  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
701 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
620 aa  125  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
902 aa  124  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
710 aa  124  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
754 aa  124  1e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  24.74 
 
 
516 aa  124  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  24.64 
 
 
595 aa  124  1e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0908  histidine kinase  32.1 
 
 
388 aa  123  2e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  33.07 
 
 
574 aa  123  2e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.32 
 
 
584 aa  123  2e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
456 aa  123  2e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>