More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3014 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 209 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2103  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  28.22 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  22.6 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0232  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  34.51 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  31.06 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  27.05 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 283 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  21.53 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 125 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0799  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126774  normal  0.374704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 200 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 190 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 280 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  20.1 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  36.94 
 
 		 233 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 223 aa  53.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  31.86 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 275 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1965  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 207 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 220 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 200 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 200 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>