More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2990 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2990  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
272 aa  552  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.508852  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2858  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.78 
 
 
269 aa  282  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1252  indole-3-glycerol-phosphate synthase  57.89 
 
 
269 aa  280  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2300  indole-3-glycerol-phosphate synthase  54.89 
 
 
273 aa  266  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0956436  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.57 
 
 
259 aa  224  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.32 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.19 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  47.35 
 
 
259 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.15 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1188  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.35 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0171952  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.9 
 
 
295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
266 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.17 
 
 
268 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.76 
 
 
268 aa  208  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.94 
 
 
262 aa  205  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.65 
 
 
266 aa  205  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.07 
 
 
285 aa  205  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.08 
 
 
265 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.07 
 
 
268 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0251  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45 
 
 
265 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
295 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
296 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  43.45 
 
 
288 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00648  Anthranilate synthase component 2 (EC 4.1.3.27)(Anthranilate synthase component II) [Includes Glutamine amidotransferase;Indole-3-glycerol phosphate synthase(IGPS)(EC 4.1.1.48);N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase(PRAI)(EC 5.3.1.24)] [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P06531]  45.02 
 
 
664 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.56 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
258 aa  200  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.7 
 
 
268 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.73 
 
 
258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.96 
 
 
285 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  47.33 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.47 
 
 
294 aa  198  7.999999999999999e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
293 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.35 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.59 
 
 
285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.95 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.18 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.07 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.53 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.71 
 
 
265 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
266 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.54 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.91 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.75 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.95 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0594  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.75 
 
 
278 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.28 
 
 
271 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  45.38 
 
 
273 aa  195  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
263 aa  194  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.57 
 
 
263 aa  194  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.91 
 
 
266 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.96 
 
 
258 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.49 
 
 
264 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.28 
 
 
266 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.28 
 
 
266 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.49 
 
 
264 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.31 
 
 
297 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.52 
 
 
276 aa  192  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.13 
 
 
264 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.58 
 
 
263 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.65 
 
 
265 aa  191  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1138  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.11 
 
 
269 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.69839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.92 
 
 
264 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2587  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.59 
 
 
265 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.804047  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
267 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
265 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3181  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.78 
 
 
270 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  45.31 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0174  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.13 
 
 
257 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
285 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  42.47 
 
 
271 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0792  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.12 
 
 
278 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5042  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.81 
 
 
302 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1393  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.26 
 
 
295 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2024  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
262 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0145  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.02 
 
 
267 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.694484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0909  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.96 
 
 
271 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000352387  hitchhiker  0.00000000301828 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14961  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.52 
 
 
295 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.147831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  48.2 
 
 
266 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.57 
 
 
271 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.29 
 
 
288 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.3 
 
 
266 aa  186  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.36 
 
 
258 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.28 
 
 
278 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.66 
 
 
267 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0680  indole-3-glycerol phosphate synthase protein  41.26 
 
 
268 aa  185  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.694431  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0361  indole-3-glycerol-phosphate synthase  47.96 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14821  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.38 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.42 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3397  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.06 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4579  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.28 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0514187  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  40.07 
 
 
294 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1409  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.7 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.827257  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.07 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  42.86 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0770  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.04 
 
 
267 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383206  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.91 
 
 
272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0478  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.57 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2222  indole-3-glycerol phosphate synthase  44.32 
 
 
262 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.688049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>