More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2973 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 
144 aa  294  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  66.67 
 
 
147 aa  184  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 
157 aa  184  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  66.41 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 
145 aa  174  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 
156 aa  172  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 
148 aa  167  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 
155 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  58.16 
 
 
155 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 
156 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 
145 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  54.93 
 
 
162 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 
161 aa  157  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  52.08 
 
 
151 aa  156  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
150 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 
179 aa  155  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
142 aa  155  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 
147 aa  155  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 
153 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  53.85 
 
 
149 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 
150 aa  155  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
154 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  53.57 
 
 
153 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  51.39 
 
 
151 aa  154  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.81 
 
 
149 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
150 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
150 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
150 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 
149 aa  153  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0026  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 
152 aa  153  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 
152 aa  153  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
155 aa  153  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.8 
 
 
150 aa  152  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
159 aa  152  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  57.66 
 
 
162 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
147 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 
150 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
148 aa  151  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
207 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.63 
 
 
152 aa  150  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 
151 aa  150  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.37 
 
 
145 aa  150  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 
150 aa  150  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  55.15 
 
 
146 aa  150  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
152 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 
144 aa  150  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
149 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 
156 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 
146 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
150 aa  149  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 
149 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 
148 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
146 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
146 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
146 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
146 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
146 aa  148  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
146 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
145 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 
152 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
207 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  47.14 
 
 
146 aa  149  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  46.43 
 
 
146 aa  148  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
207 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
150 aa  148  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  49.29 
 
 
159 aa  148  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 
145 aa  147  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 
145 aa  148  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
150 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
150 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  51.33 
 
 
178 aa  147  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
150 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
150 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 
150 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 
150 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 
158 aa  147  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 
149 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.67 
 
 
144 aa  147  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 
150 aa  146  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 
156 aa  146  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
151 aa  146  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
144 aa  146  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
144 aa  146  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.47 
 
 
184 aa  146  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 
151 aa  146  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
151 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
151 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 
151 aa  146  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  48.18 
 
 
156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  50.71 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 
144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>