More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2926 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  100 
 
 
444 aa  900    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  60.37 
 
 
454 aa  521  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  61.93 
 
 
461 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  59.45 
 
 
454 aa  515  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  53.33 
 
 
441 aa  441  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  49.18 
 
 
415 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  48.26 
 
 
433 aa  373  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  47.56 
 
 
421 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  45.45 
 
 
436 aa  345  7e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.41 
 
 
489 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.41 
 
 
489 aa  334  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_643  GTP-binding protein  56.12 
 
 
403 aa  334  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.13619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0667  GTP-binding protein, HSR1-related  50.26 
 
 
403 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000065557  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  41.37 
 
 
519 aa  332  6e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_002936  DET0737  GTP-binding protein, putative  51.92 
 
 
380 aa  331  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.085807  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  45.62 
 
 
437 aa  332  1e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  46.68 
 
 
414 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  45 
 
 
509 aa  328  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  45.89 
 
 
431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6253  GTP-binding proten HflX  49.55 
 
 
426 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.12 
 
 
493 aa  326  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  44.37 
 
 
502 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  47.55 
 
 
482 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.38 
 
 
442 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  44.72 
 
 
481 aa  322  6e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0567  GTP-binding protein, HSR1-related  45.95 
 
 
432 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.102684  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  45.88 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  47.29 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  46.21 
 
 
432 aa  317  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3121  GTP-binding proten HflX  44.11 
 
 
411 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  45.48 
 
 
422 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.01 
 
 
429 aa  317  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  45.5 
 
 
435 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.01 
 
 
429 aa  315  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  43.98 
 
 
429 aa  315  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  45.48 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  47 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  45.21 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0598  GTP-binding protein, HSR1-related  45.75 
 
 
435 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.472321  hitchhiker  0.00000215533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0326  GTP-binding protein HflX  44.96 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.81 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.86 
 
 
436 aa  312  5.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  43.03 
 
 
420 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  46.63 
 
 
433 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  43.42 
 
 
484 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0477  GTP-binding proten HflX  48.95 
 
 
401 aa  311  1e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00918489  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  46.86 
 
 
521 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  46.63 
 
 
433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3237  GTP-binding protein, HSR1-related  44.1 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.32 
 
 
395 aa  310  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  43.98 
 
 
435 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  43.66 
 
 
432 aa  309  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.77 
 
 
429 aa  310  5e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0604  GTP-binding protein HflX  45.25 
 
 
435 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  42.66 
 
 
413 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3279  GTP-binding protein, HSR1-related  45.25 
 
 
435 aa  308  8e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00360977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1174  GTP-binding protein HflX  45.28 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.929711  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0599  GTP-binding protein, HSR1-related  45.5 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00843062  hitchhiker  0.00021975 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3431  GTP-binding protein, HSR1-related  45.5 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253406  normal  0.0436905 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  40.53 
 
 
419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0559  GTP-binding protein, HSR1-related  45 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3766  GTP-binding protein HSR1-related  45 
 
 
435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000736905  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4167  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000123151  unclonable  0.00000000000307153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1693  GTP-binding protein  41.01 
 
 
419 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.78132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1828  GTP-binding protein  41.01 
 
 
419 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1171  GTP-binding protein, HSR1-related  44.69 
 
 
409 aa  306  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3709  GTP-binding proten HflX  45 
 
 
435 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.153718  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3892  GTP-binding proten HflX  45 
 
 
435 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.030857  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.91 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  43.82 
 
 
479 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0970  GTP-binding proten HflX  46.2 
 
 
433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  43.57 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  45.77 
 
 
512 aa  306  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1689  GTP1/OBG protein  40.77 
 
 
419 aa  306  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1886  GTP-binding protein HflX  43.22 
 
 
406 aa  305  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.968139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04515  GTP-binding protein HflX  51.99 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.546831  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1087  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.37 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.824642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  41.01 
 
 
419 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  45.94 
 
 
522 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  44.24 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  43.81 
 
 
501 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1835  GTP-binding protein  40.77 
 
 
419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  45.43 
 
 
439 aa  303  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  45.06 
 
 
501 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.77 
 
 
426 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  40.77 
 
 
419 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  40.77 
 
 
419 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  40.53 
 
 
419 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  43.33 
 
 
493 aa  302  9e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  43.17 
 
 
428 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.77 
 
 
426 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  43.17 
 
 
428 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  43.17 
 
 
428 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  40.77 
 
 
419 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  47.23 
 
 
524 aa  302  1e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  44.63 
 
 
433 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  47.71 
 
 
433 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  44.63 
 
 
433 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  44.44 
 
 
426 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  44.63 
 
 
433 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>