More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2799 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  100 
 
 
236 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  73.42 
 
 
224 aa  324  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  72.97 
 
 
224 aa  321  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.16 
 
 
225 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 
228 aa  262  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.22 
 
 
224 aa  258  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.78 
 
 
224 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.12 
 
 
225 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.6 
 
 
228 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 
223 aa  246  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  54.95 
 
 
224 aa  244  9e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  58.04 
 
 
226 aa  243  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  54.71 
 
 
227 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 
233 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  51.63 
 
 
246 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  50.9 
 
 
224 aa  235  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 
240 aa  234  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  55.86 
 
 
225 aa  234  8e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  51.35 
 
 
224 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
224 aa  232  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  52.79 
 
 
237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 
228 aa  226  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1103  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.16 
 
 
227 aa  226  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 
230 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 
225 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 
230 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 
230 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
228 aa  225  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  50.22 
 
 
223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2637  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.02 
 
 
227 aa  224  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 
273 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
224 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
224 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 
231 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 
225 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 
224 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 
222 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 
231 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
224 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
226 aa  222  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  49.78 
 
 
230 aa  222  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  53.12 
 
 
406 aa  221  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  50.67 
 
 
236 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 
235 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 
245 aa  220  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 
224 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  49.11 
 
 
224 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  50.68 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 
226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3055  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.78 
 
 
227 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.703147  hitchhiker  0.000223036 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.21 
 
 
223 aa  214  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 
227 aa  214  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  50.22 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  48.67 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.78 
 
 
229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5186  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3349  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.43 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  50 
 
 
232 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1497  heavy metal response regulator  47.14 
 
 
228 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  52.54 
 
 
235 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.95 
 
 
224 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  53.91 
 
 
231 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  51.11 
 
 
221 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.58 
 
 
223 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 
224 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  46.43 
 
 
224 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 
227 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.09 
 
 
223 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001641  putative two component response regulator transcription regulator protein  47.35 
 
 
230 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.170142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 
248 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 
225 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 
230 aa  209  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.42 
 
 
225 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  45.89 
 
 
233 aa  209  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4757  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.64 
 
 
223 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0878196  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.98 
 
 
225 aa  208  5e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3410  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.64 
 
 
223 aa  208  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  45.09 
 
 
227 aa  208  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.51 
 
 
229 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  48.89 
 
 
257 aa  208  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 
238 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.27 
 
 
225 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  46.98 
 
 
240 aa  208  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1307  DNA-binding heavy metal response regulator  46.9 
 
 
225 aa  207  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150056  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
219 aa  207  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 
225 aa  207  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 
232 aa  207  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
229 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  43.24 
 
 
219 aa  207  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.58 
 
 
232 aa  207  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  48.21 
 
 
226 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  48.21 
 
 
228 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.87 
 
 
230 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 
223 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.12 
 
 
254 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>