More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2669 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2669  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 88 aa  181  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000924332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  74.71 
 
 		 91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2002  50S ribosomal protein L27  77.65 
 
 		 85 aa  133  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.245442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2696  50S ribosomal protein L27  75.29 
 
 		 85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000136289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0489  ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 86 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  59.3 
 
 		 91 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1379  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  62.07 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2057  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 87 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.976216  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1326  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1108  ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000226179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1137  50S ribosomal protein L27  63.41 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00024272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3418  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3674  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.99139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2181  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.128983  normal  0.935252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4217  50S ribosomal protein L27  60 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  60.71 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0771  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2691  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0303281  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1269  50S ribosomal protein L27  65.22 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000774064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0019  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2249  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0281332  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  56.98 
 
 		 92 aa  105  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0842  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.987021  normal  0.6635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5485  50S ribosomal protein L27  68.12 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.132015  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  53.41 
 
 		 95 aa  104  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  58.43 
 
 		 89 aa  103  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  56.82 
 
 		 90 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 98 aa  103  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  55.68 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2651  ribosomal protein L27  55.81 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000469897  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1120  50S ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 87 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.645406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0503  ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3314  50S ribosomal protein L27  61.63 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000201837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1725  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  57.14 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2227  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0838  50S ribosomal protein L27  56.47 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.34705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  60.24 
 
 		 84 aa  100  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  58.14 
 
 		 90 aa  100  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0996  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 85 aa  100  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  56.32 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  59.52 
 
 		 83 aa  100  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0750  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 		 85 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00233026 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1341  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00883743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  59.77 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  55.68 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 95 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0110  50S ribosomal protein L27  56.82 
 
 		 87 aa  99.4  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000081142  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  57.65 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0087  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 83 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000279495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 		 97 aa  99.8  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  53.41 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 93 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  59.26 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  58.82 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0184  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  59.04 
 
 		 89 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  53.57 
 
 		 92 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05534  50S ribosomal protein L27  55.81 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000340822  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  53.41 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4327  50S ribosomal protein L27  56.63 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  55.95 
 
 		 84 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  51.14 
 
 		 92 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  58.54 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 		 93 aa  97.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  57.95 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  58.62 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0750  ribosomal protein L27  53.01 
 
 		 90 aa  97.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000003902  hitchhiker  0.00471075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  58.33 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  57.83 
 
 		 85 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  60.47 
 
 		 85 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  55.29 
 
 		 87 aa  97.4  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  52.38 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  54.12 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  52.94 
 
 		 93 aa  96.7  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  55.17 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>