36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2664 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
365 aa  748  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.82 
 
 
453 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  58.78 
 
 
500 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  58.09 
 
 
432 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.53 
 
 
406 aa  65.9  1e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.58618e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  36.17 
 
 
392 aa  59.3  1e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  34.92 
 
 
382 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  34.58 
 
 
351 aa  58.5  2e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.73 
 
 
378 aa  55.8  1e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.33 
 
 
382 aa  54.7  2e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  27.31 
 
 
423 aa  54.7  3e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.72 
 
 
262 aa  54.3  4e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.5 
 
 
382 aa  53.1  7e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  32.5 
 
 
382 aa  53.1  8e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0001  bacteriocin  33.33 
 
 
879 aa  52.4  1e-05  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.71 
 
 
405 aa  52  2e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.32 
 
 
384 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  48.78 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  unclonable  1.87913e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.47 
 
 
889 aa  47.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  29.89 
 
 
375 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4763  hypothetical protein  36.99 
 
 
368 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0626394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  30.46 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  33.66 
 
 
388 aa  46.2  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1734  murein peptide amidase A  34.72 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.461062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2614  murein peptide amidase A  30.65 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.964461  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  30 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.73445e-07  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2149  murein peptide amidase A  34.85 
 
 
237 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  33.66 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  29.17 
 
 
821 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.17 
 
 
497 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5441  hypothetical protein  28.07 
 
 
490 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.228309  normal  0.756779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5494  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.5 
 
 
218 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136631  normal  0.114762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.11 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2320  murein peptide amidase A  34.78 
 
 
239 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.836285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.36 
 
 
375 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1905  murein peptide amidase A  26.15 
 
 
256 aa  42.7  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>