275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2646 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 812 aa  1651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  59.31 
 
 		 927 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  51.94 
 
 		 895 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  51.88 
 
 		 1224 aa  617  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  49.84 
 
 		 885 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  55.03 
 
 		 775 aa  588  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  49.43 
 
 		 874 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.61 
 
 		 998 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.23 
 
 		 867 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  50.17 
 
 		 762 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  46.93 
 
 		 1100 aa  523  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  41.83 
 
 		 875 aa  522  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  50.7 
 
 		 851 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  47.93 
 
 		 864 aa  512  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  48.84 
 
 		 1105 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.17 
 
 		 786 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.8 
 
 		 611 aa  398  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  34.56 
 
 		 587 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.06 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  34.7 
 
 		 854 aa  260  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  31.01 
 
 		 591 aa  251  6e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  32.95 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  30.47 
 
 		 571 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  31.83 
 
 		 646 aa  231  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 649 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 1601 aa  189  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  28.92 
 
 		 537 aa  187  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.53 
 
 		 833 aa  173  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  53.59 
 
 		 609 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  51.72 
 
 		 846 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  28.3 
 
 		 739 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.45 
 
 		 900 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  55.14 
 
 		 1128 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2138  cellulose-binding family II protein  47.49 
 
 		 942 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.368421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  57.43 
 
 		 633 aa  124  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  52.34 
 
 		 854 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  57.43 
 
 		 588 aa  118  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  51.46 
 
 		 842 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  53.47 
 
 		 590 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  27.56 
 
 		 803 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  27.7 
 
 		 632 aa  114  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  51.43 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  50.48 
 
 		 913 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.8 
 
 		 486 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  27.29 
 
 		 665 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  43.83 
 
 		 694 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  49.5 
 
 		 596 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  50.98 
 
 		 778 aa  105  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  45.28 
 
 		 773 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 420 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  51 
 
 		 966 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  44.86 
 
 		 488 aa  103  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  46.36 
 
 		 963 aa  103  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 1055 aa  102  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 688 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  46.53 
 
 		 681 aa  101  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  47.06 
 
 		 494 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  46.08 
 
 		 518 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 774 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  45.54 
 
 		 455 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  45.54 
 
 		 469 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6685  cellulose-binding family II  48.57 
 
 		 533 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  41.86 
 
 		 794 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.6 
 
 		 984 aa  99  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.71 
 
 		 767 aa  99.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  44.55 
 
 		 894 aa  98.6  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  43.56 
 
 		 743 aa  98.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  48.51 
 
 		 459 aa  97.4  9e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  45.71 
 
 		 499 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  40.19 
 
 		 746 aa  96.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3536  cellulose-binding family II  52.48 
 
 		 389 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0870492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3718  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 525 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  48.57 
 
 		 979 aa  95.9  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  48.04 
 
 		 446 aa  95.1  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6555  glycoside hydrolase family 6  45.54 
 
 		 487 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123763  normal  0.307137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  46.53 
 
 		 436 aa  95.1  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  52.27 
 
 		 460 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.9 
 
 		 491 aa  94  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  45.19 
 
 		 934 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  40.59 
 
 		 744 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3602  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 620 aa  92  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.438732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  39.05 
 
 		 495 aa  91.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  46.32 
 
 		 474 aa  90.9  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6682  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 935 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  42.11 
 
 		 785 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  43.69 
 
 		 371 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  47.52 
 
 		 1042 aa  90.5  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  41.44 
 
 		 423 aa  90.5  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  46.15 
 
 		 690 aa  89.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2191  glycoside hydrolase family 6  44.12 
 
 		 605 aa  89.4  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2745  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 376 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  42.31 
 
 		 489 aa  89  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  46.6 
 
 		 646 aa  88.2  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  43.56 
 
 		 393 aa  87.8  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  43.75 
 
 		 485 aa  87.4  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.59 
 
 		 456 aa  87.4  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  49.53 
 
 		 829 aa  87.4  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  43.01 
 
 		 1209 aa  87  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  46.15 
 
 		 854 aa  87.4  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0735  glycoside hydrolase family 6  43.69 
 
 		 623 aa  87  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0698323  normal  0.806764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>