143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2635 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  100 
 
 
571 aa  1126    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.1 
 
 
613 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.52 
 
 
544 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  23.29 
 
 
544 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  23.29 
 
 
544 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.91 
 
 
549 aa  125  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  22.71 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  23.77 
 
 
549 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  22.77 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  24.02 
 
 
547 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  22.99 
 
 
547 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.79 
 
 
590 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  26.71 
 
 
578 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  27.23 
 
 
560 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.62 
 
 
927 aa  89.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  23.44 
 
 
439 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  24.63 
 
 
663 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  26.03 
 
 
546 aa  73.9  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.7 
 
 
651 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  26.87 
 
 
559 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  25.04 
 
 
649 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  31.37 
 
 
173 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  37.75 
 
 
310 aa  66.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  28.52 
 
 
309 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  28.52 
 
 
309 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  28.21 
 
 
309 aa  63.9  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  30.81 
 
 
671 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  25.93 
 
 
697 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 
141 aa  61.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 
141 aa  61.2  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  33.15 
 
 
679 aa  61.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  30.66 
 
 
364 aa  60.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 
588 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 
106 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 
124 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
513 aa  57.4  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  28.4 
 
 
565 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  31.58 
 
 
722 aa  57  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  28.4 
 
 
564 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  30.65 
 
 
188 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  27.22 
 
 
295 aa  53.9  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  35.04 
 
 
678 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 
124 aa  53.5  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  31.58 
 
 
126 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 
869 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  27.06 
 
 
299 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  33.08 
 
 
708 aa  52.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 
119 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 
182 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  31.58 
 
 
129 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  31.58 
 
 
129 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 
208 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  34.03 
 
 
576 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.35 
 
 
687 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 
120 aa  51.2  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  28.99 
 
 
528 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  25.45 
 
 
400 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  27.81 
 
 
184 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  36.25 
 
 
160 aa  51.2  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  30.82 
 
 
291 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  28.66 
 
 
172 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  33 
 
 
125 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 
174 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 
131 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 
174 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.67 
 
 
731 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  28.45 
 
 
124 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  29.24 
 
 
686 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 
139 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  26.98 
 
 
687 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  25.54 
 
 
291 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  31.11 
 
 
172 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 
126 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 
593 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  29.81 
 
 
146 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 
174 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.69 
 
 
309 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  27.5 
 
 
290 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 
124 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 
207 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.57 
 
 
197 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  27.59 
 
 
124 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  27.59 
 
 
124 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  27.59 
 
 
124 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  26.74 
 
 
718 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 
118 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 
196 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 
244 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  26.79 
 
 
124 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  27.59 
 
 
124 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  30.14 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  30.14 
 
 
291 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  32.63 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 
121 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.78 
 
 
675 aa  48.5  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 
121 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  32.63 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  27.59 
 
 
124 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  27.59 
 
 
124 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 
121 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>