More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2531 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  100 
 
 
148 aa  306  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2194  SUF system FeS assembly protein  60.77 
 
 
161 aa  165  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  61.9 
 
 
134 aa  152  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  58.91 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0977  nitrogen-fixing NifU-like protein  45.38 
 
 
134 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.64156  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0953  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.57 
 
 
128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.29 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.38 
 
 
143 aa  94  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.84 
 
 
128 aa  94  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.35 
 
 
139 aa  92  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.23 
 
 
131 aa  90.5  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.35 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.62 
 
 
143 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.85 
 
 
207 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.75 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.07 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.71 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.66 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  36.64 
 
 
140 aa  81.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  38.79 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  34.59 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  33.83 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.21 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0290  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.21 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.33 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2186  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.87 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  31.91 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.04 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.91 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2138  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.87 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  35.34 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.21 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  32.17 
 
 
211 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1787  SUF system FeS assembly protein  34.9 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0971844  normal  0.163448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.59 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.66 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.33 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.54 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  40.24 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  34.31 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1002  SUF system FeS assembly protein, NifU family  33.85 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0651104  normal  0.492699 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1411  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.85 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1457  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.85 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  33.33 
 
 
153 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  33.58 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0221  NifU family protein  36.36 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  34.68 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  34.45 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2737  NifU family SUF system FeS assembly protein  30.14 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1277  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0307655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1169  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.310149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0434  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163571 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1504  SUF system FeS assembly protein, NifU family protein  31.21 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.46 
 
 
277 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3510  scaffold protein  34.43 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.65 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  43.59 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.54 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  32.48 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  30.43 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  34.68 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  34.13 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4473  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.11 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  34.68 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1424  iron-binding protein IscU  33.87 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1928  NifU domain-containing protein  31.4 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46543  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3673  NifU family SUF system FeS assembly protein  31.11 
 
 
155 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.905267  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.61 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0873  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0843  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0886  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272267  hitchhiker  0.000151152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  31.58 
 
 
284 aa  66.6  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  29.32 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  33.61 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40390  scaffold protein  34.43 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1238  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4611  scaffold protein  34.92 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0619086  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.38 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4335  scaffold protein  33.87 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.258722  hitchhiker  0.00000000135167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.38 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  36.97 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  33.87 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1962  scaffold protein  33.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0186056  hitchhiker  0.00197009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2148  scaffold protein  33.87 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00245787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  32.26 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2396  scaffold protein  33.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2385  scaffold protein  33.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000223926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  31.2 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.04 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2501  scaffold protein  33.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0368834  normal  0.021811 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  34.96 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1145  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.19 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  34.68 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  32.79 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  32.03 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  38.64 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  36.13 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  33.91 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2654  scaffold protein  32.82 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.978602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2598  scaffold protein  32.82 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0662204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>