47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2501 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2501  sarcosine oxidase alpha subunit  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.295491  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.59 
 
 		 591 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0998615  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2598  sarcosine oxidase, alpha subunit  41.03 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2844  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  41.03 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000266999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2647  sarcosine oxidase subunit alpha, N-terminal  41.03 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0375869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2563  sarcosine oxidase, alpha subunit  39.74 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0876  putative ferredoxin-containing oxidase  43.48 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4669  ferredoxin  38.46 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646461  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1842  ferredoxin  45 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2443  sarcosine oxidase alpha subunit  37.18 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0360142  normal  0.998563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2850  sarcosine oxidase alpha subunit  37.18 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00413596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2641  sarcosine oxidase, alpha subunit  37.18 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00222021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2889  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  40.3 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.36789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4725  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5218  hypothetical protein  41.89 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0877789  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01437  sarcosine oxidase alpha subunit  52.27 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.354445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 983 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4124  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00126127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0083  hypothetical protein  33.78 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31610  hypothetical protein  32.91 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000038  hypothetical protein  31.17 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5701  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6065  hypothetical protein  34.62 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4445  ferredoxin  51.06 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.94814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4424  putative sarcosine oxidase alpha subunit  31.17 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2065  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  46.43 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4399  putative sarcosine oxidase alpha subunit  30.67 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1932  putative sarcosine oxidase alpha subunit  36.36 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1832  SoxA protein  27.5 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.537733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1889  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1892  ferredoxin  50 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1417  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0975187  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2197  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725852  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0572  hypothetical protein  51.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.313492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0475  hypothetical protein  51.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6549  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851972  normal  0.34224 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0883  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  51.11 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6007  hypothetical protein  29.87 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00459941  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3377  ferredoxin  50 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264604  normal  0.288176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5918  hypothetical protein  28.77 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000277826  normal  0.0333521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4033  ferredoxin  50 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3552  ferredoxin  50 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4108  ferredoxin  30.67 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0719298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1687  hypothetical protein  32.89 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.410801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6499  hypothetical protein  33.78 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  32.2 
 
 		 960 aa  40.4  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 984 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>