67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2456 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 245 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  30.67 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  26.78 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 228 aa  88.6  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  26.5 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  33.48 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  25.22 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  28.75 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  29.69 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  26.96 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  24.45 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  24.45 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  31 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.07 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  30.56 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  27.43 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  21.01 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  27.39 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  28.32 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  31.11 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  29.28 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  38.75 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  32.16 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  27.35 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  23.39 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  26.79 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  25.83 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  27.06 
 
 		 309 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  34.78 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  26.91 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  30.67 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  23.66 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  27.83 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  27.87 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  29.18 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  29.26 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  27.51 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  27.97 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  36.63 
 
 		 228 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  25.56 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  26.34 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  24.66 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  27.97 
 
 		 230 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  30.83 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  29.66 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  25.81 
 
 		 266 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  32.29 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  29.18 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  35.14 
 
 		 214 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  25 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  30.82 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  25.75 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  24.12 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  26.36 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  24.7 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  29.07 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  23.87 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  25.1 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  23.83 
 
 		 208 aa  42.4  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  29.61 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  26.58 
 
 		 223 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>