More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2434 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 237 aa  65.1  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  29.81 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 291 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3590  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  33 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 324 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  31.33 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>