More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2398 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  100 
 
 
368 aa  748    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  48.79 
 
 
353 aa  292  6e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  45.57 
 
 
339 aa  285  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  42.09 
 
 
341 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  38.99 
 
 
341 aa  255  7e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 
342 aa  253  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  41.9 
 
 
333 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  41.84 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  41.19 
 
 
342 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  41.03 
 
 
348 aa  232  7.000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.88 
 
 
337 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  42.34 
 
 
340 aa  232  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  40.36 
 
 
348 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.18 
 
 
352 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  38.48 
 
 
332 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  38.53 
 
 
335 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  38.48 
 
 
332 aa  229  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  38.18 
 
 
332 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  39.17 
 
 
340 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  37.61 
 
 
339 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.83 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.35 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  38.76 
 
 
342 aa  225  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 
331 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  39.94 
 
 
353 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  42.12 
 
 
331 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  37.58 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  41.03 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.95 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  38.37 
 
 
330 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.98 
 
 
347 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  40.47 
 
 
336 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 
347 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 
337 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.76 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.32 
 
 
337 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 
336 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 
336 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  38.73 
 
 
349 aa  216  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.91 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  39.04 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  38.07 
 
 
330 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36.47 
 
 
331 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 
335 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  38.6 
 
 
337 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.48 
 
 
342 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.48 
 
 
342 aa  213  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 
358 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  36.39 
 
 
334 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 
336 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  37.65 
 
 
338 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  35.42 
 
 
334 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.01 
 
 
347 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 
341 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 
338 aa  209  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 
346 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.16 
 
 
335 aa  209  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  37.95 
 
 
335 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  36.97 
 
 
332 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 
359 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  37.5 
 
 
342 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  36.92 
 
 
342 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  36.67 
 
 
332 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.8 
 
 
346 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  34.24 
 
 
361 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.76 
 
 
333 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 
338 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  35.61 
 
 
368 aa  206  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  36.83 
 
 
337 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.82 
 
 
342 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 
339 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  38.17 
 
 
338 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  39.4 
 
 
338 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  35.89 
 
 
334 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.06 
 
 
356 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  36.7 
 
 
338 aa  205  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 
341 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  35.37 
 
 
334 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 
333 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  38.08 
 
 
323 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.53 
 
 
333 aa  204  2e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 
357 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.45 
 
 
339 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.17 
 
 
330 aa  204  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.28 
 
 
341 aa  204  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.99 
 
 
343 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.59 
 
 
332 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 
336 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  35.15 
 
 
333 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.89 
 
 
341 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 
340 aa  202  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>