47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2382 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  51.43 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  51.91 
 
 		 154 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  39.66 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  39.66 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  39.66 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  39.66 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.6 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  32.86 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.31 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.31 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.31 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  36.09 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.59 
 
 		 369 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.85 
 
 		 382 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  31.3 
 
 		 133 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  33.33 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  32.5 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.61 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.23 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 440 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.9 
 
 		 452 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  35.04 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  37.8 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  33.33 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 366 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.07 
 
 		 364 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  30.4 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 412 aa  52  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 411 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.1 
 
 		 427 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  28.57 
 
 		 142 aa  50.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  32.76 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  30 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.58 
 
 		 402 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  29.57 
 
 		 376 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  33.06 
 
 		 132 aa  45.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  33.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  30.37 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  34.44 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  33.33 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 412 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>