38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2355 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2355  appr-1-p processing domain-containing protein  100 
 
 
150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0936  Appr-1-p processing domain protein  50.34 
 
 
349 aa  167  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2929  appr-1-p processing domain-containing protein  48.67 
 
 
345 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000529825  hitchhiker  0.000428474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1489  Appr-1-p processing protein  56.72 
 
 
331 aa  159  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000625886  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3594  Appr-1-p processing domain protein  50 
 
 
351 aa  156  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000210462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2198  Appr-1-p processing domain protein  46.98 
 
 
351 aa  156  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0161  appr-1-p processing domain-containing protein  47.33 
 
 
353 aa  156  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133487  decreased coverage  0.000000361839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2099  Appr-1-p processing domain protein  54.55 
 
 
345 aa  156  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10059  hypothetical protein  50.67 
 
 
352 aa  155  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2281899999999994e-51  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0297  appr-1-p processing domain-containing protein  50.34 
 
 
354 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114927  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0503  appr-1-p processing domain-containing protein  50.34 
 
 
362 aa  152  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3529  appr-1-p processing domain-containing protein  48.99 
 
 
346 aa  150  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1468  hypothetical protein  45.33 
 
 
353 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0910  appr-1-p processing domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  137  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.998324  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0862  Appr-1-p processing domain protein  45.64 
 
 
355 aa  136  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5541  Appr-1-p processing domain protein  47.83 
 
 
357 aa  133  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0616045  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0391  hypothetical protein, ADP-ribose binding protein  42.67 
 
 
341 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0566  appr-1-p processing domain-containing protein  49.24 
 
 
360 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00315958  decreased coverage  0.00000000000000126999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5129  hypothetical protein  46.81 
 
 
362 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1715  appr-1-p processing domain-containing protein  43.41 
 
 
397 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00091392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1660  Appr-1-p processing domain protein  38.3 
 
 
242 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000103868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0073  hypothetical protein  34.38 
 
 
393 aa  94  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000146563  unclonable  0.00000000120063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1300  hypothetical protein  40.17 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  93.6  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4398  Appr-1-p processing domain protein  31.34 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4411  Appr-1-p processing domain protein  31.82 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2730  Appr-1-p processing domain protein  28.38 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000300309  hitchhiker  0.00298668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0142  hypothetical protein  26.53 
 
 
158 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3562  hypothetical protein  27.66 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41970  hypothetical protein  26.95 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1069  appr-1-p processing domain-containing protein  27.68 
 
 
147 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0960  Appr-1-p processing  25.19 
 
 
179 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3196  Appr-1-p processing domain protein  25.68 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0081  hypothetical protein  21.86 
 
 
190 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.71142  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2476  Appr-1-p processing domain protein  25 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370869 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49619  predicted protein  32.22 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.624995  normal  0.141248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1160  appr-1-p processing domain-containing protein  28.23 
 
 
167 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.429654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2786  Appr-1-p processing  22.76 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>