More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2345 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  100 
 
 
326 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  50.96 
 
 
349 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  50.16 
 
 
349 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0899  Polyprenyl synthetase  53.87 
 
 
361 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0021773  hitchhiker  0.000000547465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 
320 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.87 
 
 
320 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.39 
 
 
322 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  37.3 
 
 
322 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
320 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
320 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.59 
 
 
320 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
320 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.28 
 
 
320 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.59 
 
 
320 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0392  polyprenyl synthetase  41.01 
 
 
317 aa  208  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.56 
 
 
320 aa  208  9e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.65 
 
 
320 aa  208  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.76 
 
 
320 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.94 
 
 
322 aa  205  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  36.34 
 
 
322 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.05 
 
 
323 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  32.59 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  32.59 
 
 
319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.26 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.05 
 
 
322 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  38.98 
 
 
323 aa  194  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  35.9 
 
 
336 aa  193  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  34.73 
 
 
322 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.94 
 
 
318 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  36.1 
 
 
335 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 
336 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  35.2 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  31.35 
 
 
319 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  36.54 
 
 
322 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  35.11 
 
 
323 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.06 
 
 
324 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.75 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.5 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.46 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  34.81 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  36.98 
 
 
345 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.72 
 
 
326 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  35.05 
 
 
340 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  34.94 
 
 
336 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  34.66 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  35.11 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  35.05 
 
 
351 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  34.78 
 
 
322 aa  182  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  34.73 
 
 
340 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  33.13 
 
 
324 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 
331 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.9 
 
 
322 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 
331 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  33.01 
 
 
337 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  34.29 
 
 
331 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  34.08 
 
 
336 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0855  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.215594  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  35.46 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  35.46 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  33.76 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  32.41 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  34.94 
 
 
341 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  33.55 
 
 
323 aa  179  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2084  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 
326 aa  178  1e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.235717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  33.76 
 
 
336 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 
331 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  33.76 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  32.8 
 
 
322 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  31.27 
 
 
318 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  33.97 
 
 
331 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.16 
 
 
333 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.16 
 
 
333 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  35.48 
 
 
323 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0088  octaprenyl-diphosphate synthase  30.94 
 
 
325 aa  177  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.52685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  34.41 
 
 
323 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  32.29 
 
 
323 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  35.05 
 
 
323 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  33.44 
 
 
336 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  34.92 
 
 
338 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  33.54 
 
 
323 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.56 
 
 
340 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.95 
 
 
339 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  35.46 
 
 
323 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  32.48 
 
 
322 aa  176  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  36.16 
 
 
333 aa  176  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.62 
 
 
333 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.56 
 
 
356 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  33.44 
 
 
322 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  36.74 
 
 
331 aa  176  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  34.07 
 
 
337 aa  176  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  36.89 
 
 
322 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.15 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  32.69 
 
 
311 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1738  polyprenyl synthetase family protein  32.08 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  31.06 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>