72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2335 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.5 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.56 
 
 		 284 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.32 
 
 		 281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  32.46 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.07 
 
 		 381 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.46 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  30.8 
 
 		 387 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000592794 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.23 
 
 		 390 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.42 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.82 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.2 
 
 		 368 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.58 
 
 		 376 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.33 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.03 
 
 		 391 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.57 
 
 		 281 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  31.95 
 
 		 389 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.56 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  32.08 
 
 		 372 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  27.52 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  29.5 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.85 
 
 		 387 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.16 
 
 		 377 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.92 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.71 
 
 		 391 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  26.74 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29 
 
 		 383 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  31.03 
 
 		 362 aa  88.6  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.68 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.8 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.6 
 
 		 382 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.6 
 
 		 382 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.5 
 
 		 362 aa  85.5  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.69 
 
 		 394 aa  85.5  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  28.68 
 
 		 377 aa  85.5  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  31.16 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.56 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.26 
 
 		 381 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.84 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.24 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.73 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000232035  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  31.09 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.04 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.88 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.42 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  21.95 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.64 
 
 		 491 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  31.96 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000478387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.64 
 
 		 519 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  25.93 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000190734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4844  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.03 
 
 		 520 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0669  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  21.79 
 
 		 567 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  21.2 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0920  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.11 
 
 		 506 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.79 
 
 		 554 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.79 
 
 		 554 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  21.79 
 
 		 554 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  20.43 
 
 		 571 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  25.86 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.86 
 
 		 510 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1214  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.01 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.14 
 
 		 577 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  20.07 
 
 		 569 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.81 
 
 		 516 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.53 
 
 		 503 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2449  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.57 
 
 		 502 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.448467  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3677  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.1 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1103  uroporphyrinogen-III synthase  25.93 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0908711  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1482  putative uroporphyrinogen III synthase  25 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.360624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.02 
 
 		 510 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01871  putative uroporphyrinogen III synthase  21.95 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.773561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  21.32 
 
 		 516 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>