291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2322 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
521 aa  1035    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  60.46 
 
 
523 aa  631  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  34.6 
 
 
549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
556 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  45.34 
 
 
359 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  37.6 
 
 
568 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  37.39 
 
 
559 aa  127  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  31.22 
 
 
511 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  41.36 
 
 
361 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  42.38 
 
 
344 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  43.12 
 
 
388 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  39.53 
 
 
385 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  38.86 
 
 
372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  26.49 
 
 
580 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 
361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  39.41 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  39.89 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  44.93 
 
 
370 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 
385 aa  113  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  33.62 
 
 
425 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  34.66 
 
 
371 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  41.21 
 
 
433 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  37.57 
 
 
231 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  42.76 
 
 
315 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  41.56 
 
 
291 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  38.36 
 
 
275 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  42.58 
 
 
362 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  30.68 
 
 
372 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  42.07 
 
 
306 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  42.11 
 
 
377 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  46.72 
 
 
281 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  41.45 
 
 
509 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  31.09 
 
 
357 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  49.52 
 
 
293 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  46.88 
 
 
653 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  45.07 
 
 
357 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  34.27 
 
 
363 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  40.14 
 
 
367 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  44.76 
 
 
376 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  47.41 
 
 
271 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  36.69 
 
 
359 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  46.55 
 
 
667 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  43.66 
 
 
388 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  31.02 
 
 
422 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0868  anti-sigma-factor antagonist  30.8 
 
 
506 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  42.34 
 
 
272 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  45.6 
 
 
653 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1037  putative PAS/PAC sensor protein  37.96 
 
 
484 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  44.63 
 
 
312 aa  101  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  39.87 
 
 
323 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  33.49 
 
 
421 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  47.93 
 
 
295 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  39.44 
 
 
538 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  41.61 
 
 
549 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 
365 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 
359 aa  100  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  41.55 
 
 
439 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  43.17 
 
 
430 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2931  anti-sigma-factor antagonist  27.6 
 
 
338 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353591  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  37.91 
 
 
290 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  46.34 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 
380 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  45.3 
 
 
271 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1835  anti-sigma-factor antagonist  38.97 
 
 
331 aa  97.4  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 
295 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  47.41 
 
 
271 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  40.91 
 
 
252 aa  96.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1708  putative PAS/PAC sensor protein  39.17 
 
 
444 aa  96.7  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  43.07 
 
 
424 aa  97.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  37.5 
 
 
325 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 
358 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  29.34 
 
 
365 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0409  putative PAS/PAC sensor protein  35.04 
 
 
492 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 
286 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  38.79 
 
 
315 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  44.55 
 
 
638 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  44.14 
 
 
292 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  42.98 
 
 
292 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  42.97 
 
 
286 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  41.13 
 
 
288 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  29.6 
 
 
280 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  40.98 
 
 
283 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  42.37 
 
 
655 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4192  anti-sigma-factor antagonist  36.5 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  33.5 
 
 
367 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  40.16 
 
 
689 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  42.15 
 
 
287 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  41.23 
 
 
445 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  30.99 
 
 
411 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  41.23 
 
 
291 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  42.15 
 
 
288 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  42.98 
 
 
694 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  41.96 
 
 
562 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  33.74 
 
 
286 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0052  anti-sigma-factor antagonist  38.58 
 
 
350 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  41.32 
 
 
429 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1098  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 
514 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  41.94 
 
 
653 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  43.86 
 
 
428 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  38.81 
 
 
357 aa  90.9  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>