87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2258 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1071    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.96 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  30.25 
 
 		 591 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  30.21 
 
 		 591 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  28.3 
 
 		 655 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  25.83 
 
 		 575 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  25.64 
 
 		 575 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  28.14 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  27.87 
 
 		 509 aa  88.6  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  28.88 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  27.61 
 
 		 572 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  26.22 
 
 		 659 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.27 
 
 		 558 aa  80.1  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  28.66 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  26.76 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  26.1 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  25.23 
 
 		 665 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  30.74 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  27.86 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  28.18 
 
 		 526 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  27.96 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.97 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  31.97 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  27.75 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  35.64 
 
 		 2042 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  30.97 
 
 		 454 aa  68.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  26.77 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  30.85 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  32.38 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  27.46 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  26.1 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.27 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  29.68 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  26.73 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  27.84 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  26.6 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.02 
 
 		 479 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  26.33 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  35.77 
 
 		 384 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.42 
 
 		 2192 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.66 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  29.64 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  27.08 
 
 		 2160 aa  58.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  26.79 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  27.72 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1061 aa  57  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  23.24 
 
 		 518 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  27.14 
 
 		 362 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  25.88 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  28.4 
 
 		 759 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  27.74 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  25.97 
 
 		 767 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  27.6 
 
 		 462 aa  53.9  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  25.94 
 
 		 439 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  31.14 
 
 		 466 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  23.84 
 
 		 527 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  27.67 
 
 		 863 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  30.82 
 
 		 457 aa  51.6  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  28.37 
 
 		 505 aa  51.2  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  25.94 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  30.96 
 
 		 493 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  28.07 
 
 		 446 aa  51.2  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3328  polymorphic outer membrane protein  35.71 
 
 		 272 aa  50.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000184033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  26.87 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  24.89 
 
 		 1359 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  44.62 
 
 		 870 aa  50.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.96 
 
 		 884 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  29.26 
 
 		 532 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  47.27 
 
 		 786 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  30.13 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  29.53 
 
 		 462 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  26.08 
 
 		 852 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.99 
 
 		 1296 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  27.16 
 
 		 433 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  31.2 
 
 		 545 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.87 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  23.88 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  28.8 
 
 		 717 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  28.25 
 
 		 731 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 329 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1023 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  27.68 
 
 		 415 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  26.49 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  28.19 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  31.58 
 
 		 523 aa  43.9  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  30.88 
 
 		 464 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  23.95 
 
 		 523 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>