74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2233 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
205 aa  429  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  45.45 
 
 
200 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  44.39 
 
 
196 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  1.01589e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  43.85 
 
 
196 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2461  CRISPR-associated protein Cas4  44.92 
 
 
196 aa  162  2e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  41.58 
 
 
216 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4560  CRISPR-associated protein Cas4  37.37 
 
 
194 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4175  hypothetical protein  35.05 
 
 
196 aa  133  2e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  1.76829e-05 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  40.49 
 
 
559 aa  131  8e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1299  hypothetical protein  37.89 
 
 
214 aa  130  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.938866  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1432  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.54 
 
 
214 aa  130  1e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.343364  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0822  CRISPR-associated protein Cas4  37.23 
 
 
206 aa  128  5e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2652  CRISPR-associated protein Cas4  39.66 
 
 
212 aa  127  8e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0303971  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2974  CRISPR-associated Cas4 family protein  40 
 
 
212 aa  127  1e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3372  hypothetical protein  39.36 
 
 
218 aa  126  2e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1478  CRISPR-associated protein Cas4  41.62 
 
 
218 aa  127  2e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.470243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1661  CRISPR-associated protein Cas4  37.89 
 
 
214 aa  126  2e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.975016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  40.11 
 
 
216 aa  125  4e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.62 
 
 
210 aa  124  8e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.56 
 
 
544 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  37.57 
 
 
545 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1006  hypothetical protein  36.73 
 
 
215 aa  122  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0356084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1070  hypothetical protein  37.17 
 
 
204 aa  117  1e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0265039 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  32.5 
 
 
224 aa  115  4e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0793  CRISPR-associated protein Cas4  41.21 
 
 
209 aa  114  1e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813459  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3507  PE-PGRS family protein  37.43 
 
 
190 aa  114  1e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0494  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  34.81 
 
 
214 aa  114  1e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  35.53 
 
 
550 aa  113  2e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  1.41365e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.05 
 
 
208 aa  113  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0832  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.57 
 
 
228 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02697  crispr-associated protein Cas4  37.43 
 
 
210 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1975  CRISPR-associated protein Cas4  37.43 
 
 
255 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.29 
 
 
219 aa  110  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  36.55 
 
 
570 aa  110  2e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3647  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
225 aa  109  4e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3523  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  37.56 
 
 
218 aa  108  4e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0479  RecB family exonuclease  32.16 
 
 
234 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.957708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31590  CRISPR-associated protein Cas4  35.75 
 
 
199 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1632  CRISPR-associated protein Cas4  36.32 
 
 
218 aa  103  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.98908 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1481  CRISPR-associated protein Cas4  29.21 
 
 
222 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.11 
 
 
211 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2187  CRISPR-associated protein Cas4  30.85 
 
 
223 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.43 
 
 
193 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4331  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.18 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  8.54832e-05  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  33.99 
 
 
553 aa  98.6  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1975  CRISPR-associated protein Cas4  31.4 
 
 
220 aa  98.6  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360978  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 
594 aa  97.1  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.39 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3906  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.46 
 
 
212 aa  95.5  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164887  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1558  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.35 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.681932  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  28.17 
 
 
598 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  29.7 
 
 
580 aa  83.6  2e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2343  hypothetical protein  29.8 
 
 
333 aa  83.6  2e-15  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3345  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.89 
 
 
221 aa  82.4  5e-15  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0218123  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3577  CRISPR-associated protein Cas4  30.43 
 
 
190 aa  80.5  2e-14  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.32 
 
 
191 aa  72.4  4e-12  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5519  CRISPR-associated protein Cas1  29.17 
 
 
558 aa  67  2e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  25.81 
 
 
189 aa  65.9  4e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  26.18 
 
 
202 aa  59.3  4e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  24.02 
 
 
198 aa  58.2  9e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.13 
 
 
198 aa  57.4  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.4 
 
 
197 aa  57  2e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.77 
 
 
204 aa  55.1  8e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.24 
 
 
190 aa  53.9  2e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.59 
 
 
198 aa  52.4  5e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.13 
 
 
172 aa  51.6  7e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2841  CRISPR-associated protein Cas1  26.23 
 
 
525 aa  50.8  1e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00141566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  25.85 
 
 
206 aa  49.7  3e-05  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5083  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.14 
 
 
197 aa  48.1  9e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2060  hypothetical protein  30.58 
 
 
236 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.456181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  25.41 
 
 
195 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  25 
 
 
209 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  30.33 
 
 
170 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1502  hypothetical protein  30.95 
 
 
102 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.314393 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>