More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2226 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  29.49 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  26.51 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.31 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  41.43 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  28.24 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1784  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>