148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2169 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  39.74 
 
 		 3907 aa  2406    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 4357 aa  8815    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  27.32 
 
 		 3861 aa  416  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.26 
 
 		 3822 aa  389  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  31.35 
 
 		 4009 aa  191  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  31.83 
 
 		 4022 aa  190  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  43.98 
 
 		 456 aa  126  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  42.44 
 
 		 1263 aa  119  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  43.59 
 
 		 940 aa  95.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  30.09 
 
 		 2117 aa  94.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  37.34 
 
 		 364 aa  91.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  34.17 
 
 		 309 aa  90.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  38.99 
 
 		 401 aa  88.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  37.74 
 
 		 406 aa  86.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  33.8 
 
 		 14609 aa  79.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  32.69 
 
 		 1159 aa  79.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  51.79 
 
 		 1394 aa  79.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  37.5 
 
 		 911 aa  79.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  31.22 
 
 		 793 aa  78.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  37.66 
 
 		 767 aa  76.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  28.94 
 
 		 1035 aa  74.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  29.83 
 
 		 865 aa  73.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  34.62 
 
 		 339 aa  73.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1076 aa  72.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  32.48 
 
 		 369 aa  72  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  25.89 
 
 		 6678 aa  70.9  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0640  hypothetical protein  29.19 
 
 		 250 aa  70.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000266751  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  31.21 
 
 		 318 aa  70.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  30.45 
 
 		 252 aa  69.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  42.5 
 
 		 778 aa  67.8  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  53.54 
 
 		 830 aa  67.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  42.51 
 
 		 1390 aa  67.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1027 aa  67.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  45.56 
 
 		 2082 aa  67.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  39.67 
 
 		 1831 aa  67.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.41 
 
 		 4761 aa  67.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.57 
 
 		 11716 aa  66.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  32.85 
 
 		 1699 aa  66.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  29.76 
 
 		 720 aa  65.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  33.48 
 
 		 846 aa  65.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.42 
 
 		 1013 aa  65.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  26.94 
 
 		 250 aa  65.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  31.79 
 
 		 4433 aa  65.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  54.32 
 
 		 356 aa  63.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  31.41 
 
 		 433 aa  63.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  38.54 
 
 		 331 aa  63.9  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.22 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1101 aa  63.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.95 
 
 		 306 aa  62  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 1121 aa  62  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  37.67 
 
 		 1487 aa  62  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25 
 
 		 3507 aa  61.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  34.84 
 
 		 692 aa  61.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  33.08 
 
 		 1188 aa  60.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  28.16 
 
 		 407 aa  60.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  30.11 
 
 		 316 aa  60.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  29.26 
 
 		 1150 aa  60.8  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  41.98 
 
 		 1095 aa  60.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  23.74 
 
 		 1121 aa  60.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.39 
 
 		 1222 aa  60.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.62 
 
 		 1323 aa  60.1  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  40.74 
 
 		 839 aa  59.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  43.53 
 
 		 845 aa  59.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  39.51 
 
 		 321 aa  58.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 1143 aa  58.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 		 440 aa  58.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1576 aa  57.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  28.74 
 
 		 757 aa  57.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  23.46 
 
 		 1121 aa  57.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  56.82 
 
 		 456 aa  57.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  45.07 
 
 		 3027 aa  57  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  43.66 
 
 		 2002 aa  57  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1367 aa  56.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1374 aa  56.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2966  PKD domain containing protein  25.4 
 
 		 531 aa  56.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.506413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  50.56 
 
 		 453 aa  56.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 1577 aa  56.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  27.65 
 
 		 2066 aa  56.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1504 aa  55.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  26.32 
 
 		 739 aa  55.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.02 
 
 		 1679 aa  55.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  49.41 
 
 		 455 aa  56.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  27.24 
 
 		 739 aa  55.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  29.94 
 
 		 432 aa  55.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2131  Laminin G sub domain 2  27.81 
 
 		 981 aa  55.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  35.97 
 
 		 1316 aa  55.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1908 aa  55.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  38.24 
 
 		 830 aa  55.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.46 
 
 		 1072 aa  55.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  45.33 
 
 		 864 aa  54.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  31.82 
 
 		 792 aa  54.7  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  38.18 
 
 		 474 aa  54.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  28.05 
 
 		 643 aa  54.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  48.33 
 
 		 1107 aa  53.5  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.09 
 
 		 555 aa  53.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  31.22 
 
 		 846 aa  52.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  40.23 
 
 		 489 aa  52.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  42.72 
 
 		 916 aa  52.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  26.46 
 
 		 1310 aa  52.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1738  hypothetical protein  28.07 
 
 		 249 aa  52.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>