More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2164 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  100 
 
 
346 aa  702  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  44.77 
 
 
336 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  31.02 
 
 
300 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.46 
 
 
672 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 
275 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  28.22 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  33.8 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
353 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  29.17 
 
 
353 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.9 
 
 
358 aa  82.8  8e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.09 
 
 
282 aa  82.4  1e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  30 
 
 
308 aa  81.3  2e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.63 
 
 
330 aa  80.1  5e-14  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  25.64 
 
 
291 aa  79  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
317 aa  78.6  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  32.68 
 
 
194 aa  77.4  3e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
306 aa  77.8  3e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  27.55 
 
 
305 aa  77.4  3e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
267 aa  75.9  9e-13  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  25.32 
 
 
298 aa  75.5  1e-12  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  27.8 
 
 
310 aa  75.5  1e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  36.5 
 
 
308 aa  75.1  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03350  hypothetical protein  29.11 
 
 
285 aa  74.7  2e-12  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  28 
 
 
310 aa  74.3  3e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  34.53 
 
 
233 aa  73.6  5e-12  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 
281 aa  72.8  9e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1243  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.4 
 
 
329 aa  72.4  1e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  32.64 
 
 
396 aa  70.5  5e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1879  Methyltransferase type 11  28.4 
 
 
314 aa  69.3  9e-11  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 
316 aa  67.4  3e-10  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
323 aa  67.4  4e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
323 aa  67.4  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.48 
 
 
572 aa  67  4e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 
310 aa  66.6  7e-10  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  25.21 
 
 
310 aa  66.6  7e-10  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  33.77 
 
 
330 aa  66.2  7e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.33 
 
 
415 aa  66.2  8e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 
333 aa  65.9  9e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
303 aa  65.9  1e-09  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
1177 aa  65.5  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
1177 aa  65.9  1e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0628  hypothetical protein  32.93 
 
 
312 aa  64.7  2e-09  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
214 aa  64.7  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.83 
 
 
332 aa  65.1  2e-09  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30 
 
 
332 aa  64.7  2e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  37 
 
 
305 aa  64.3  3e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  24.07 
 
 
407 aa  63.9  4e-09  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  21.85 
 
 
298 aa  63.5  5e-09  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  30.46 
 
 
311 aa  63.5  5e-09  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.72 
 
 
345 aa  63.2  6e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1754  FkbM family methyltransferase  32.71 
 
 
488 aa  62.8  8e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  32.21 
 
 
298 aa  62.4  1e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  25.81 
 
 
229 aa  62.4  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.52 
 
 
238 aa  61.2  2e-08  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  28.24 
 
 
274 aa  61.2  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5277  methyltransferase type 12  27.41 
 
 
625 aa  61.6  2e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.11 
 
 
235 aa  62  2e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  3.18811e-06 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
273 aa  60.5  4e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  27.68 
 
 
409 aa  60.5  4e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  27.88 
 
 
240 aa  60.5  4e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
513 aa  60.1  5e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2104  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like protein  29.24 
 
 
304 aa  60.1  5e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.352054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.77 
 
 
277 aa  59.3  9e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
219 aa  58.9  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  28.51 
 
 
309 aa  58.9  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26.26 
 
 
229 aa  58.9  1e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 
234 aa  58.5  1e-07  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  27.23 
 
 
409 aa  58.9  1e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
211 aa  58.9  1e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  26.19 
 
 
229 aa  58.5  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.61 
 
 
243 aa  58.5  2e-07  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.45 
 
 
229 aa  58.5  2e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  1.65496e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  25.27 
 
 
228 aa  58.2  2e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  27.54 
 
 
334 aa  58.2  2e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  26.19 
 
 
229 aa  58.2  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  27.97 
 
 
391 aa  58.2  2e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  26.19 
 
 
229 aa  57.4  3e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  34.01 
 
 
1523 aa  57.8  3e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  26.19 
 
 
229 aa  57.4  3e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  26.19 
 
 
229 aa  57.4  3e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  26.46 
 
 
286 aa  57.8  3e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  26.19 
 
 
229 aa  57.4  3e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  25.81 
 
 
229 aa  57.4  4e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  29.05 
 
 
283 aa  57.4  4e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  27 
 
 
409 aa  57.4  4e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.75 
 
 
238 aa  57  4e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  6.08227e-06  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  24.34 
 
 
323 aa  57  4e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
279 aa  57  5e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  26.06 
 
 
413 aa  57  5e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  26.19 
 
 
335 aa  56.6  6e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  32.52 
 
 
237 aa  56.6  6e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  29.94 
 
 
408 aa  56.6  7e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  25.7 
 
 
229 aa  56.2  9e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  31.2 
 
 
303 aa  55.5  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  29.58 
 
 
1046 aa  55.8  1e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  25 
 
 
306 aa  55.8  1e-06  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  26.06 
 
 
413 aa  55.5  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
225 aa  55.5  1e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  24.49 
 
 
215 aa  55.5  1e-06  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
245 aa  55.8  1e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>