More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2122 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2122  histidine kinase internal region  100 
 
 
516 aa  1047    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1227  histidine kinase  36.53 
 
 
488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
585 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
580 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19850  histidine kinase internal region  38.98 
 
 
595 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2252  histidine kinase internal region  38.81 
 
 
569 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1983  putative sensor with HAMP domain  38.46 
 
 
597 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  44.06 
 
 
604 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1137  putative sensor with HAMP domain  38.91 
 
 
597 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0994  putative sensor with HAMP domain  36.82 
 
 
603 aa  189  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4590  putative sensor with HAMP domain  37.97 
 
 
577 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0578  histidine kinase internal region  38.37 
 
 
604 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0199  putative sensor with HAMP domain  36.24 
 
 
589 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  37.97 
 
 
600 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
576 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  37.32 
 
 
603 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  37.25 
 
 
414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
502 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  31.92 
 
 
627 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0599  putative sensor with HAMP domain  35.37 
 
 
623 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.396658  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0398  histidine kinase internal region  37.88 
 
 
567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  35.71 
 
 
610 aa  156  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 
600 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  36.61 
 
 
410 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0292  signal transduction histidine kinase, LytS  39.25 
 
 
506 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.98 
 
 
576 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0538  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
583 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0554  sensor histidine kinase  30.82 
 
 
583 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  35.94 
 
 
607 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  35.75 
 
 
410 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2140  histidine kinase internal region  31.29 
 
 
564 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 
578 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  33.21 
 
 
587 aa  146  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0863  histidine kinase internal region  31.91 
 
 
599 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  32.09 
 
 
594 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1646  putative sensor with HAMP domain  32.17 
 
 
617 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  32.92 
 
 
612 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 
574 aa  140  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  26.95 
 
 
495 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3033  histidine kinase internal region  29.93 
 
 
633 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0284117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0526  histidine kinase internal region  32.65 
 
 
594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  37.67 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 
483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 
557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  36.02 
 
 
603 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  38.81 
 
 
403 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  37.17 
 
 
564 aa  133  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
640 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000785951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3281  signal transduction histidine kinase, LytS  36.32 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
563 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  30.36 
 
 
580 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  35.39 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2057  sensor histidine kinase  31.85 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
565 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
563 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 
565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1112  sensor histidine kinase  29.52 
 
 
574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0193784  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
561 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  33.02 
 
 
576 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  35.05 
 
 
426 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
561 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2345  sensor histidine kinase  31.45 
 
 
578 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0123193  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
561 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
561 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1250  signal transduction histidine kinase, LytS  30.71 
 
 
574 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.888178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  34.07 
 
 
572 aa  127  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  32.23 
 
 
561 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  34.07 
 
 
572 aa  126  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  35.47 
 
 
446 aa  126  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  35.59 
 
 
565 aa  126  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  32.77 
 
 
565 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 
559 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  34.53 
 
 
411 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1393  histidine kinase internal region  34.47 
 
 
586 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217072  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  32.62 
 
 
567 aa  124  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  33.47 
 
 
465 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  33.62 
 
 
558 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
561 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 
558 aa  124  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  32.74 
 
 
397 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2372  histidine kinase internal region  37.07 
 
 
595 aa  123  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3212  histidine kinase internal region  29 
 
 
596 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.56 
 
 
568 aa  123  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  31.28 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  32.23 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  31.28 
 
 
561 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  33.03 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 
408 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  32.2 
 
 
394 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  33.94 
 
 
363 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  31.28 
 
 
561 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  32.31 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  28.01 
 
 
498 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  32.88 
 
 
402 aa  119  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>