30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2110 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  100 
 
 		 435 aa  890    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  34.45 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  32.15 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  30.65 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  32.81 
 
 		 437 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  30.83 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  31.31 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.44 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  28.91 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.79 
 
 		 396 aa  106  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.65 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  27.02 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.51 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  25.72 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  25 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.56 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  24.8 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  26.23 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.89 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  24.73 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  23.72 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>