More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2001 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  100 
 
 
425 aa  834    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  51.11 
 
 
411 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  48.47 
 
 
394 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  45.75 
 
 
425 aa  351  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  49.87 
 
 
450 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  37.53 
 
 
425 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  33.73 
 
 
430 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
439 aa  170  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.1 
 
 
1833 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  27 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  30.84 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  29.72 
 
 
405 aa  164  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 
415 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
440 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  28.71 
 
 
411 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
406 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  30.25 
 
 
438 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
412 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  28.17 
 
 
397 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  29.03 
 
 
414 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
434 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
434 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  27.06 
 
 
397 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
463 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
458 aa  143  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  30.46 
 
 
1816 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
432 aa  137  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
439 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  30.29 
 
 
454 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  29.58 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 
438 aa  126  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  26.09 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  25.78 
 
 
410 aa  120  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.64 
 
 
422 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
432 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
432 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 
432 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  25.06 
 
 
485 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
499 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.26 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.59 
 
 
1806 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.81 
 
 
432 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.19 
 
 
1829 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 
444 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25.5 
 
 
412 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  31.14 
 
 
1769 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  26.06 
 
 
422 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.67 
 
 
474 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
448 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  26.09 
 
 
422 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  22.63 
 
 
406 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.87 
 
 
1864 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.56 
 
 
2720 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.63 
 
 
406 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
432 aa  104  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  28.34 
 
 
449 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.75 
 
 
412 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.84 
 
 
1776 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
419 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 
437 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.73 
 
 
422 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.77 
 
 
390 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.77 
 
 
390 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.4 
 
 
422 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.39 
 
 
422 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.4 
 
 
422 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.4 
 
 
422 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.13 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  27.81 
 
 
449 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  26.06 
 
 
399 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  36.36 
 
 
134 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
431 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  21.08 
 
 
431 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  21.67 
 
 
441 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.33 
 
 
422 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.97 
 
 
1876 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  26.94 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.94 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.61 
 
 
404 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  20.57 
 
 
432 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
422 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.52 
 
 
441 aa  94  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  26.95 
 
 
443 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.43 
 
 
406 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  26.76 
 
 
414 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  35.29 
 
 
495 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  20.1 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  24.55 
 
 
447 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
414 aa  92  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.97 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.47 
 
 
424 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  21.57 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  21.15 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 
433 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  24.51 
 
 
410 aa  90.1  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  26.2 
 
 
417 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>