102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1999 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  100 
 
 		 3907 aa  7989    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  39.81 
 
 		 4357 aa  2458    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  27.37 
 
 		 3861 aa  459  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  27.57 
 
 		 3822 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  24.71 
 
 		 4009 aa  239  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  24.86 
 
 		 4022 aa  239  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1078  Laminin G sub domain 2  36.9 
 
 		 911 aa  89.4  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.476778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.43 
 
 		 830 aa  84.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  43.66 
 
 		 1394 aa  83.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  36.09 
 
 		 14609 aa  73.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  32.98 
 
 		 4761 aa  70.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  56.92 
 
 		 692 aa  69.7  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1122  laminin G  29.11 
 
 		 406 aa  68.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3962  laminin G  30.95 
 
 		 401 aa  68.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1504 aa  68.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3963  LamG domain-containing protein  27.85 
 
 		 309 aa  68.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1773  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  31.43 
 
 		 288 aa  68.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327647  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5918  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.74 
 
 		 306 aa  68.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.521345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1699 aa  66.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3964  LamG domain-containing protein  27.85 
 
 		 364 aa  65.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  40.8 
 
 		 916 aa  65.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  32.26 
 
 		 767 aa  64.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  43.44 
 
 		 453 aa  63.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1374 aa  63.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  29.35 
 
 		 1310 aa  63.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.17 
 
 		 11716 aa  62.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  25.74 
 
 		 793 aa  62  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  40.16 
 
 		 1831 aa  62.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  28.69 
 
 		 671 aa  61.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  25.32 
 
 		 1159 aa  61.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.79 
 
 		 407 aa  61.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.55 
 
 		 1035 aa  60.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  35.11 
 
 		 3507 aa  59.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  23.03 
 
 		 433 aa  58.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 1188 aa  58.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  46.67 
 
 		 830 aa  58.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3169  LamG domain-containing protein  27.27 
 
 		 339 aa  57.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  42.54 
 
 		 625 aa  57  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  28.4 
 
 		 1306 aa  57  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3200  hypothetical protein  27.85 
 
 		 307 aa  56.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00274431  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1123  LamG domain-containing protein  24.43 
 
 		 318 aa  55.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  47.54 
 
 		 1107 aa  56.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27 
 
 		 607 aa  55.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  26.63 
 
 		 739 aa  55.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.6 
 
 		 598 aa  55.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3759  PT repeat-containing protein  40.66 
 
 		 259 aa  55.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2229  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.67 
 
 		 273 aa  55.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0720047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  28.11 
 
 		 6678 aa  55.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  27.8 
 
 		 792 aa  54.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  26.63 
 
 		 739 aa  55.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  41.18 
 
 		 564 aa  53.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1124  LamG domain-containing protein  25.45 
 
 		 369 aa  53.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.53 
 
 		 1072 aa  53.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  47.5 
 
 		 846 aa  53.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  30.98 
 
 		 252 aa  53.5  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1447  PT repeat-containing protein  34.53 
 
 		 618 aa  53.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  35.51 
 
 		 778 aa  53.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  52.44 
 
 		 356 aa  53.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  43.84 
 
 		 914 aa  52.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.59 
 
 		 1735 aa  52.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2750  YD repeat protein  29.73 
 
 		 2447 aa  53.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  30.22 
 
 		 846 aa  52.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1316 aa  53.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  23 
 
 		 424 aa  52.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  28.48 
 
 		 1577 aa  52  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7437  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1101 aa  52  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  28.26 
 
 		 2066 aa  52  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  35.62 
 
 		 1487 aa  51.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  35.35 
 
 		 323 aa  51.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.86 
 
 		 1600 aa  51.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  29.65 
 
 		 1908 aa  51.2  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  28.49 
 
 		 316 aa  50.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 462 aa  50.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1367 aa  50.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1247  Peptidase M23  35.71 
 
 		 791 aa  50.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.98 
 
 		 257 aa  50.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  27.59 
 
 		 864 aa  50.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1260 aa  49.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.36 
 
 		 4433 aa  49.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0941  hypothetical protein  31.52 
 
 		 747 aa  49.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.654154  hitchhiker  0.0000135929 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  40.74 
 
 		 1096 aa  49.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0483  hypothetical protein  42.42 
 
 		 476 aa  49.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.105295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 293 aa  49.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1576 aa  48.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  30.37 
 
 		 682 aa  48.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  38.74 
 
 		 474 aa  48.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  41.05 
 
 		 456 aa  48.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.57 
 
 		 236 aa  48.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 		 603 aa  47.8  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  48.65 
 
 		 455 aa  47.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0878  hypothetical protein  29.94 
 
 		 508 aa  47.8  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192628  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  41.98 
 
 		 3027 aa  47.8  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 		 555 aa  47.4  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  33.7 
 
 		 1009 aa  47.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  34.09 
 
 		 471 aa  47.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2039  hypothetical protein  30.57 
 
 		 248 aa  47.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  40 
 
 		 605 aa  47  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  26.61 
 
 		 722 aa  47  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  24.17 
 
 		 501 aa  47  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.32 
 
 		 1064 aa  46.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>