34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1990 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1990  tail collar domain-containing protein  100 
 
 		 865 aa  1785    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1973  tail collar domain-containing protein  42.6 
 
 		 934 aa  233  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  29.83 
 
 		 4357 aa  73.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1091  phage tail Collar  23.55 
 
 		 671 aa  72.8  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.152489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3381  tail collar domain-containing protein  32.47 
 
 		 261 aa  72  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  hitchhiker  0.000000000100675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  27.85 
 
 		 848 aa  67.4  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  23.41 
 
 		 1121 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  22.93 
 
 		 1121 aa  60.1  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  22.93 
 
 		 1121 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0240  microcystin-dependent protein-like  26.1 
 
 		 268 aa  56.6  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4880  Tail Collar domain protein  31.41 
 
 		 181 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382325  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  27.14 
 
 		 252 aa  54.3  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1917  phage tail collar domain-containing protein  27.92 
 
 		 176 aa  53.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319876  hitchhiker  0.0068131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.77 
 
 		 236 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0238  hypothetical protein  23.2 
 
 		 323 aa  51.2  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0701154  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  25 
 
 		 4761 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0165  phage tail collar domain-containing protein  32.2 
 
 		 199 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 1112 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4190  phage tail collar domain-containing protein  32.2 
 
 		 199 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  25.13 
 
 		 316 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0169  tail collar domain-containing protein  32.2 
 
 		 199 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0939231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5676  tail collar domain-containing protein  32.73 
 
 		 414 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.204656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  29.38 
 
 		 1035 aa  49.3  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4987  tail collar domain-containing protein  25.42 
 
 		 157 aa  47.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1348  phage tail collar domain-containing protein  33.65 
 
 		 205 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3287  phage tail Collar  33.33 
 
 		 172 aa  47.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3551  phage tail collar domain-containing protein  27.97 
 
 		 199 aa  45.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3729  phage tail Collar  28.1 
 
 		 198 aa  45.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0351559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3488  tail collar domain-containing protein  27 
 
 		 182 aa  45.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353729  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.95 
 
 		 11716 aa  44.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4988  tail collar domain-containing protein  24.23 
 
 		 163 aa  45.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0665  hypothetical protein  23.56 
 
 		 250 aa  44.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4955  tail collar domain-containing protein  24.5 
 
 		 170 aa  44.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>