38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1942 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1942  hypothetical protein  100 
 
 
580 aa  1139    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0873468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2684  hypothetical protein  27.35 
 
 
621 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1794  hypothetical protein  29.28 
 
 
1245 aa  80.5  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.69552  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0932  hypothetical protein  34.13 
 
 
541 aa  79.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.315139  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0195  hypothetical protein  36.14 
 
 
522 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.966603  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1489  hypothetical protein  25.75 
 
 
623 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1651  hypothetical protein  27.63 
 
 
624 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0935  hypothetical protein  26.95 
 
 
531 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1626  hypothetical protein  26.07 
 
 
1093 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01380  hypothetical protein  26.88 
 
 
1109 aa  62.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.369989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0333  hypothetical protein  25.94 
 
 
880 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1629  hypothetical protein  26.11 
 
 
619 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2515  hypothetical protein  25.91 
 
 
652 aa  60.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0758792  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1391  hypothetical protein  25.41 
 
 
619 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.86997 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2597  hypothetical protein  25.66 
 
 
619 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2927  hypothetical protein  26.46 
 
 
1001 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0095  hypothetical protein  40.37 
 
 
514 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0223  hypothetical protein  29.11 
 
 
881 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0051  hypothetical protein  32.24 
 
 
613 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.062012 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0968  conserved hypothetical protein, membrane  25.58 
 
 
1103 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.688922  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2374  hypothetical protein  26.75 
 
 
881 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0423348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1150  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
681 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.620757  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  33.81 
 
 
658 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1844  hypothetical protein  28.49 
 
 
1005 aa  52  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0832694 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2017  hypothetical protein  25.58 
 
 
880 aa  52  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000248245  normal  0.284056 
 
 
-
 
NC_002950  PG2144  hypothetical protein  22.64 
 
 
1099 aa  52.4  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0238  hypothetical protein  30.26 
 
 
947 aa  50.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1528  hypothetical protein  26.34 
 
 
984 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0809349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0581  hypothetical protein  23.7 
 
 
1009 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.272409  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0773  hypothetical protein  24.72 
 
 
455 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000042468  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2243  hypothetical protein  27.78 
 
 
875 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4667  hypothetical protein  21.91 
 
 
1076 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0836755  hitchhiker  0.00000000312371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2186  hypothetical protein  26.97 
 
 
882 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000183684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1047  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
753 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.172621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1278  hypothetical protein  28.67 
 
 
663 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0394  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
682 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.29536  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0197  hypothetical protein  27.03 
 
 
880 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1010  hypothetical protein  21.72 
 
 
634 aa  43.9  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>