More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1884 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  70.45 
 
 
498 aa  725  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
495 aa  1027  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  57.49 
 
 
662 aa  624  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  45.61 
 
 
585 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  42.8 
 
 
512 aa  401  1e-110  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 
521 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 
508 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  41.29 
 
 
511 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 
514 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 
527 aa  363  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 
490 aa  358  1e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 
513 aa  357  2e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 
522 aa  355  7e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
511 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 
520 aa  353  3e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 
518 aa  352  9e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  37.94 
 
 
514 aa  350  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.31 
 
 
516 aa  348  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 
525 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  40.57 
 
 
500 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 
506 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 
539 aa  345  9e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
510 aa  343  3e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
510 aa  343  3e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
510 aa  343  3e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 
510 aa  343  3e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  40.81 
 
 
501 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.83 
 
 
515 aa  343  4e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
510 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.75 
 
 
510 aa  342  6e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.75 
 
 
510 aa  343  6e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.94 
 
 
510 aa  342  6e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.75 
 
 
510 aa  342  6e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 
510 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 
512 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
521 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.62 
 
 
561 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 
510 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 
499 aa  339  6e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
492 aa  337  2e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 
561 aa  338  2e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.89 
 
 
561 aa  336  4e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
519 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  41.58 
 
 
505 aa  336  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.11 
 
 
561 aa  336  6e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 
582 aa  336  6e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 
561 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 
563 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 
582 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 
563 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.75 
 
 
510 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 
563 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 
563 aa  333  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  39.64 
 
 
499 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 
551 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.91926e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 
506 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  38.54 
 
 
510 aa  328  1e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 
583 aa  325  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
557 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
566 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 
506 aa  323  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.94 
 
 
514 aa  321  2e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
564 aa  321  2e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.48 
 
 
500 aa  320  3e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 
504 aa  319  6e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
585 aa  319  8e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
549 aa  319  9e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
584 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
544 aa  316  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
569 aa  316  6e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
543 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 
507 aa  316  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 
549 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.19 
 
 
503 aa  310  3e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  37.38 
 
 
508 aa  310  3e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
561 aa  310  6e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
532 aa  308  2e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
583 aa  308  2e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.92 
 
 
555 aa  308  2e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
520 aa  308  2e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
506 aa  306  5e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 
516 aa  304  3e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 
567 aa  303  4e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 
502 aa  303  5e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.55 
 
 
522 aa  303  6e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 
630 aa  302  8e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.45 
 
 
562 aa  302  9e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 
568 aa  302  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324898  decreased coverage  0.00366167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 
511 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 
508 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
561 aa  300  3e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.85 
 
 
508 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 
548 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 
507 aa  299  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
511 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.57 
 
 
516 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
520 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 
585 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
565 aa  298  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
525 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>