More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1873 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06791  polyketide synthase, putative (JCVI)  31 
 
 
2568 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.489917  normal  0.163501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  36.85 
 
 
3670 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  35.16 
 
 
2126 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 
2545 aa  723    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  34.95 
 
 
3158 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  38.67 
 
 
3176 aa  815    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  45.47 
 
 
2232 aa  1047    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  30.67 
 
 
2534 aa  643    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  35.07 
 
 
3508 aa  705    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.85 
 
 
3645 aa  699    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  44.1 
 
 
1832 aa  964    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.08 
 
 
6889 aa  663    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  36.62 
 
 
3408 aa  671    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  38.53 
 
 
2719 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  49.13 
 
 
1939 aa  1245    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  34.17 
 
 
2546 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  36.74 
 
 
7210 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  35.67 
 
 
2126 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  36.05 
 
 
4575 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  36.31 
 
 
2108 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 
1831 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  36.43 
 
 
2220 aa  727    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.34 
 
 
2551 aa  730    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
1874 aa  844    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.73 
 
 
1656 aa  820    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  49.55 
 
 
1144 aa  864    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  44.29 
 
 
1587 aa  734    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  37.17 
 
 
2556 aa  679    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  34.1 
 
 
2546 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  34.66 
 
 
3494 aa  700    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.97 
 
 
1337 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  35.2 
 
 
2545 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  36 
 
 
2101 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  38.92 
 
 
3252 aa  652    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.4 
 
 
2604 aa  685    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  35.26 
 
 
3493 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  35.1 
 
 
2543 aa  704    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  42.94 
 
 
1559 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
5154 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.96 
 
 
3111 aa  865    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  32.92 
 
 
2543 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  42.57 
 
 
1087 aa  760    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1024  beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 
2053 aa  653    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 
2333 aa  4743    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  31.84 
 
 
2499 aa  731    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 
2544 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.35 
 
 
3693 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  41.34 
 
 
2880 aa  677    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
7110 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
1816 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  42.01 
 
 
1580 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  36.42 
 
 
2085 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  37.03 
 
 
2966 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
5400 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  36.27 
 
 
5255 aa  676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 
2551 aa  1133    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  33.88 
 
 
1909 aa  688    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.97 
 
 
1354 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  36.81 
 
 
2090 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  34.93 
 
 
1789 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  35.61 
 
 
7279 aa  700    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  36.94 
 
 
2111 aa  674    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.68 
 
 
4478 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  37.34 
 
 
1827 aa  737    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 
2544 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  35.56 
 
 
3711 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.35 
 
 
3693 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  35.5 
 
 
3679 aa  740    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.76 
 
 
1349 aa  773    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  42.07 
 
 
2762 aa  723    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  42.01 
 
 
1580 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  36.42 
 
 
2085 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
3874 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  38.53 
 
 
1823 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.26 
 
 
3676 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  40.92 
 
 
2477 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.64 
 
 
3696 aa  699    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  39.45 
 
 
1577 aa  651    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  36.98 
 
 
1805 aa  712    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  43.81 
 
 
2230 aa  982    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  40.79 
 
 
1581 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  38 
 
 
1828 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  37.61 
 
 
2547 aa  707    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  36.28 
 
 
4151 aa  679    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  34.17 
 
 
2546 aa  721    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  40.23 
 
 
3101 aa  849    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  35.7 
 
 
2486 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  34.17 
 
 
2546 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  34.04 
 
 
2546 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  37.73 
 
 
3355 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  35.53 
 
 
1876 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  34.23 
 
 
2546 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  35.54 
 
 
3702 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  34.17 
 
 
2546 aa  721    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  38.07 
 
 
2462 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  41.98 
 
 
1580 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  36.42 
 
 
2085 aa  691    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  40.16 
 
 
6768 aa  663    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  37.05 
 
 
1806 aa  699    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  37.07 
 
 
1835 aa  700    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>