More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1743 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  60.57 
 
 
535 aa  693  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  72.71 
 
 
557 aa  814  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.24409e-06  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  59.32 
 
 
536 aa  693  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  57.01 
 
 
534 aa  650  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  56.96 
 
 
542 aa  654  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  58.88 
 
 
533 aa  674  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  64.27 
 
 
535 aa  751  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  58.8 
 
 
549 aa  635  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  72.34 
 
 
555 aa  810  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  58.03 
 
 
652 aa  637  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  56.4 
 
 
553 aa  644  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  100 
 
 
534 aa  1097  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  58.69 
 
 
533 aa  674  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  59.02 
 
 
555 aa  672  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  58.33 
 
 
534 aa  657  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.36967e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  63.71 
 
 
535 aa  739  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  60.34 
 
 
534 aa  676  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.81921e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  59.32 
 
 
536 aa  693  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  60.57 
 
 
535 aa  693  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  60.94 
 
 
542 aa  707  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0497  CTP synthetase  54.61 
 
 
535 aa  637  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144764  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0519  CTP synthetase  56.79 
 
 
537 aa  660  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.354414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0193  CTP synthetase  59.02 
 
 
534 aa  682  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0420117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.99 
 
 
547 aa  649  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  58.24 
 
 
536 aa  675  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  57.49 
 
 
536 aa  662  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  59.85 
 
 
555 aa  681  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  60.8 
 
 
558 aa  690  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  63.14 
 
 
542 aa  723  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  58.05 
 
 
536 aa  673  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  58.32 
 
 
533 aa  669  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  65.35 
 
 
533 aa  742  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  63.96 
 
 
544 aa  692  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  65.47 
 
 
533 aa  729  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  63.95 
 
 
540 aa  708  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  62.59 
 
 
537 aa  692  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  58.87 
 
 
532 aa  656  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  58.14 
 
 
533 aa  640  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  60.42 
 
 
538 aa  684  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  65.16 
 
 
536 aa  731  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.43339e-08  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  58.67 
 
 
546 aa  669  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  65.22 
 
 
547 aa  728  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  63.84 
 
 
531 aa  739  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  58.95 
 
 
531 aa  659  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  58.41 
 
 
533 aa  681  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  59.62 
 
 
530 aa  654  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  65.05 
 
 
559 aa  739  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  64.72 
 
 
544 aa  697  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3086  CTP synthase  59.66 
 
 
571 aa  635  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4432  CTP synthase  58.09 
 
 
587 aa  637  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281255  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  58.13 
 
 
545 aa  639  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  61.73 
 
 
547 aa  709  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25420  CTP synthetase  58.52 
 
 
566 aa  638  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199429 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  63.71 
 
 
535 aa  740  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  58.68 
 
 
536 aa  667  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  63.33 
 
 
535 aa  737  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  61.73 
 
 
547 aa  708  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  60.94 
 
 
558 aa  696  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  56.93 
 
 
550 aa  652  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  63.52 
 
 
535 aa  738  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.97505e-06  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  63.52 
 
 
535 aa  739  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67112e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  62.95 
 
 
532 aa  716  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  71.24 
 
 
547 aa  798  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  61.55 
 
 
549 aa  675  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  64.2 
 
 
534 aa  719  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  63.3 
 
 
535 aa  714  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  62.95 
 
 
541 aa  719  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  64.97 
 
 
531 aa  757  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  61.25 
 
 
545 aa  690  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  59.66 
 
 
555 aa  678  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  63.71 
 
 
535 aa  740  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  57.22 
 
 
534 aa  644  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98786e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3157  CTP synthetase  57.81 
 
 
608 aa  651  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0522365  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  63.89 
 
 
535 aa  741  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2235  CTP synthetase  59.74 
 
 
549 aa  682  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  56.93 
 
 
548 aa  636  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1410  CTP synthetase  63.96 
 
 
544 aa  691  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0373811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  57.25 
 
 
538 aa  637  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  5.41143e-09 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0107  CTP synthetase  57.22 
 
 
534 aa  671  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0171408  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  66.42 
 
 
537 aa  750  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2872  CTP synthetase  59.63 
 
 
571 aa  679  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  63.33 
 
 
535 aa  738  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  59.92 
 
 
546 aa  674  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  60 
 
 
535 aa  691  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  60.64 
 
 
551 aa  674  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1782  CTP synthetase  58.43 
 
 
536 aa  674  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  63.71 
 
 
535 aa  740  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  61.58 
 
 
545 aa  705  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  57.06 
 
 
536 aa  637  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  63.52 
 
 
535 aa  739  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  59.36 
 
 
549 aa  679  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  57.36 
 
 
554 aa  631  1e-180  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1135  CTP synthetase  56.87 
 
 
535 aa  634  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  57.14 
 
 
546 aa  634  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1786  CTP synthetase  55.66 
 
 
544 aa  632  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  55.74 
 
 
538 aa  632  1e-180  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  58.77 
 
 
558 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  56.37 
 
 
535 aa  632  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  1.94145e-09 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  56.96 
 
 
547 aa  629  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2692  CTP synthetase  54.61 
 
 
536 aa  630  1e-179  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>